Caracterización molecular ómica de una cepa de Bacillus amyloliquefaciens aislada de la microbiota del paiche Arapaima gigas con actividad antagonista contra bacterias patógenas de peces

Abstract

Se analizaron las características de una cepa de Bacillus amyloliquefaciens aislada del intestino de Arapaima gigas, seleccionada por su capacidad para generar inhibición de múltiples bacterias patógenas de peces, mediante el uso de herramientas moleculares como PCR y espectrometría de masas - MALDI TOF/TOF. Los resultados mostraron a través de PCR que esta cepa cuenta con genes claves para la generación de péptidos antimicrobianos como bmyB (bacillomycin L synthetase B), fenD (fengycin sintetasa), srfAA (subunidad 1 surfactin sintetasa), bacA (proteína de biosíntesis de bacilysin) e iturin (iturin A). Además, mediante el análisis por espectrometría de masas se detectaron bacteriocinas (plipastatin, gramicidin, fengycin, surfactin), proteínas de fijación al intestino (like-enolase), proteinas transportadoras de péptidos antimicrobianos (ABC-transporters) y proteínas de estimulación del sistema inmunitario como flagelin. También se detectaron proteínas tipo colagenasas, chitinasas e xilosa-isomerasas que contribuyen con el proceso de digestión y asimilación. Todos estos resultados permiten considerar los múltiples beneficios de esta cepa para ser utilizada como probiótico en el cultivo de peces.

Molecular Characterization of Native Strains of Bacillus spp. in rhizospheric Soil in Three Regions of Peru

“…In the collection stage, the strawberry rhizosphere soil was used as a sample to obtain the Bacillus spp strains, similar to a work reported in the rhizosphere of cacti [19]. On the contrary, studies have been carried out where they obtain samples of mites [20], plants [21], fish [22], birds, bovines [23], fungi [24] among others. In this work, rhizospheric soil is used due to the high diversity of microbiota and the environmental conditions that favor the development of the genus Bacillus spp due to its close relationship with the roots of vegetable crops [25].…”