El presente trabajo investigativo tuvo como objetivo identificar la presencia de Aspergillus spp. y Candida spp., y su relación con los diferentes componentes de equipos respiratorios, y el entorno circundante para establecer el potencial riesgo de contaminación. Para ello, se realizó un muestreo con hisopos estériles de los equipos respiratorios, tanto de la parte proximal como distal, antes y después de estar en contacto con el paciente. Este proceso se llevó a cabo con 4 repeticiones, obteniendo un total de 160 muestras. Las mismas que fueron procesadas en el Laboratorio de Microbiología del Centro de Investigación, Innovación y Transferencia de Tecnología (CIITT) de la Universidad Católica de Cuenca. Los resultados obtenidos confirmaron la presencia de hongos nosocomiales Aspergillus y Candida al igual que de otros microorganismos patógenos. En el momento de la toma de la muestra, se observó que no existe asociatividad, pero sí una influencia en la ubicación, especialmente en el caso de Aspergillus spp, que mostró una asociatividad positiva con la superficie proximal. Además, se identificaron asociaciones significativas (p<0,05) entre la especie Aspergillus spp, y varios equipos respiratorios, a diferencia de Candida spp., que estuvo presente sin asociaciones estadísticas (p>0,05). También, se constató la presencia de un riesgo significativo en el ambiente, tubos de suministro de anestesia, tubos de ventilación mecánica y tubos endotraqueales. Estos hallazgos proporcionan información crucial para la implementación de medidas preventivas y protocolos de limpieza, mitigando así el riesgo de contaminación.