Characterization of vine varieties by SSR markers

Dokupilová, Ivana; Šturdı́k, Ernest; Mihálik, Daniel

doi:10.2478/acs-2013-0035

Cited by 8 publications

(4 citation statements)

References 32 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Using nuclear microsatellite loci (nSSR) [ 18 , 19 , 20 ] and chloroplast (cpSSR) [ 21 , 22 , 23 ] DNA which were intended for genetic identification of grapes variety is one of the approaches to DNA authentication of wines [ 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 8 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 17 , 24 , 25 , 26 ], a sequential procedure which is carried out with separately taken SSR-marker primer set, and not multiplex PCR.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Methodological Approaches to DNA Authentication of Foods, Wines and Raw Materials for Their Production

Galstyan

Semipyatny

Mikhailova

et al. 2021

Foods

View full text Add to dashboard Cite

DNA authentication of wines is a process of verifying their authenticity by genetic identification of the main plant component. The sample preparation of experimental and commercial wines was carried out by precipitation of wine debris by centrifugation with preliminary exposure with precipitators and co-precipitators, including developed macro- and micro- volume methods applicable to white or red wines, using polyvinylpyrrolidone as a co-precipitator. Addition of 2-mercaptoethanol and proteinase K to the lysing solution made it possible to adapt the technology for DNA extraction from the precipitated wine debris. The additionally tested technique of DNA extraction from wine debris by dimethyl sulfoxide (DMSO) lysis had fewer stages and, consequently, a lower risk of contamination. The results of further testing of one of the designed primer pairs (UFGT-F1 and UFGT-R1) in conjunction with the tested methods of wine material sample preparation and nucleic acid extraction, showed the advantage in the given set of oligonucleotides over previously used ones in terms of sensitivity, specificity and reproducibility. The developing strategy for genetic identification of grape varieties and DNA authentication of wines produced from them based on direct sequencing of polymerase chain reaction (PCR) products is implemented by interpreting the detected polymorphic positions of variable Vitis vinifera L. UFGT gene locus with distribution and split into 13 UFGT gene-associated groups.

show abstract

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Methodological Approaches to DNA Authentication of Foods, Wines and Raw Materials for Their Production

Galstyan

Semipyatny

Mikhailova

et al. 2021

Foods

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…The genome of Vitis vinifera L. contains a huge number of polymorphic microsatellite loci, the allelic diversity of which can be used to expose the genetic structure of grape germplasm collections maintained ex situ, as well as for detection of doublets and varietal identification (Dokupilová et al, 2013).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Genetic structure of the ampelographic collection maintained in the Dagestan experimental station of VIR revealed by microsatellite analysis

2019

Plant Genetic Resources for Breeding and Producing Functional Nutraceutical Food

View full text Add to dashboard Cite

72 grape accessions from the ampelographic collection of the Dagestan Experimental Station of VIR (DOS VIR, the North Caucasus) were evaluated with eight microsatellite markers that have been previously recommended for grape varietal identification. 132 alleles of the eight SSR loci were detected, their PIC varied in the range 0.63-0.87. Four genetic clusters (K) were outlined in the assessed genetic diversity. Each of the first three clusters combined grape accessions of the same geographical origin and represents a distinct ecological-geographical group -convar. orientalis Negr., convar. occidentalis Negr. and convar. pontica Negr. The fourth cluster included mainly hybrids.

show abstract

“…Геном V. vinifera содержит множество микросателлитных локусов, в высшей степени полиморфных (Dokupilová et al, 2013). Исследованиями Thomas et al (1993а) было показано, что в геноме винограда преобладают микросателлитные локусы, содержащие дву-и трехнуклеотидные повторы (GT)n, (GA), (CAC), (GACA)n, (GATA)n. При этом установлено, что повторы GA and GT наиболее многочисленны и распространены по всему геному.…”

Section: Introductionunclassified

The Influence of Phytohormones on the Germination of Apple Pollen in the Process of Low-Temperature Storage

Павлов¹,

Вержук²,

Sitnikov³

et al. 2018

POABG&B

View full text Add to dashboard Cite

Настоящий выпуск приурочен к 110-летию со дня основания журнала «Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции». На протяжении столетней истории журнал публиковал работы в основном сотрудников ВИР и его опытных станций и участков, расположенных в контрастных климатических зонах. Институт всегда был неразрывно связан с Журналом, который стал своего рода летописью становления и развития прикладной ботаники и селекции в России. В Томах, Сериях и Приложениях к журналу были напечатаны результаты теоретических и экспериментальных исследований по систематике, морфологии, анатомии, цитологии, кариологии, географии, генетике, иммунитету, физиологии, биохимии культурных растений и их диких родичей.Следуя традиции, мы публикуем в настоящем выпуске «живые» исследования сотрудников Института, в том числе написанные совместно с учеными из других научно-исследовательских учреждений. В выпуске представлены статьи по всем разделам журнала. Мобилизация (зернобобовые) и сохранение генетического разнообразия культурных растений и их диких родичей (Чечня, Приморский край, Вологодская обл.). Изучение и использование генетических ресурсов растений (яровой ячмень в Волгоградской обл., средиземноморские староместные сорта твердой пшеницы, озимое тритикале на Северо-Западе РФ). Коллекции мировых генетических ресурсов растений: дикорастущие виды яблони (Майкоп); фасоль обыкновенная (Санкт-Петербург); брокколи (Дагестан); хлопчатник (Краснодарский край, Астраханская обл.); соя (Адлер); виды чины (Санкт-Петербург). Генетика (подсолнечник, ячмень, картофель, яровая мягкая пшеница) и идентификация генетического разнообразия культурных растений и их диких родичей для развития приоритетных направлений селекции (яровая мягкая пшеница, виноград, восковидная кукуруза), Успехи современной селекции: слаборослые адаптивные подвои персика, многопочатковая кукуруза. Систематика: выявление генетических связей между видами рода Prunus s. l. Иммунитет культурных растений и их диких родичей: устойчивость яровой мягкой пшеницы к пыльной головне, ячменя -к ринхоспориозу, яровой мягкой пшеницы -к мучнистой росе, гибридных клонов картофеля -к фитофторозу. Обзорные статьи посвящены генеалогическому анализу генофонда черешни и фитотоксичности ионов алюминия.Табл. 79, рис.42, библиогр. 629 назв.Для ресурсоведов, ботаников, генетиков, селекционеров, преподавателей вузов биологического и сельскохозяйственного профиля.

show abstract

Characterization of vine varieties by SSR markers

Cited by 8 publications

References 32 publications

Methodological Approaches to DNA Authentication of Foods, Wines and Raw Materials for Their Production

Methodological Approaches to DNA Authentication of Foods, Wines and Raw Materials for Their Production

Genetic structure of the ampelographic collection maintained in the Dagestan experimental station of VIR revealed by microsatellite analysis

The Influence of Phytohormones on the Germination of Apple Pollen in the Process of Low-Temperature Storage

Contact Info

Product

Resources

About