Chromosomal microarrays testing in children with developmental disabilities and congenital anomalies

Abstract

Chromosomal microarray analysis is a useful and powerful tool for diagnosis of developmental diseases, by allowing accurate diagnosis, improving the diagnosis rate, and discovering new etiologies. The higher cost is a limitation for widespread use in this setting.

Partial microduplication in the histone acetyltransferase complex member KANSL1 is associated with congenital heart defects in 22q11.2 microdeletion syndrome patients

“…A third cohort corresponding to 40 individuals with congenital anomalies and/or cognitive disabilities who had chromosome microarray (CMA) for clinical reasons 20 was also studied. Eight of these 40 patients had the KANSL1 duplication (20%) and five (12.5%) had CHD.…”

Microarreglos cromosómicos en 236 pacientes chilenos con trastornos del neurodesarrollo y anomalías congénitas

“…Se destaca en este trabajo el tamaño de la muestra, que sería la más grande reportada en Sudamérica 12,17,18 y que se incluyeron pacientes provenientes de todo Chile, lo que contribuye, con mayor precisión, a conocer la prevalencia de este tipo de alteraciones genéticas en la población chilena. Por otro lado, es importante destacar que la asociación de un diagnóstico positivo por CMA con factores como el sexo del paciente, edad y el tipo de diagnóstico no habían sido descritos antes en población chilena.…”

“…12 , ambos estudios muestran una mayor derivación de pacientes del sexo masculino por sobre el femenino. Esto se explicaría por la mayor prevalencia de TN en hombres que en mujeres, reflejando la contribución de enfermedades ligadas al cromosoma X recesivas en dicha diferencia 19 y un "factor protector femenino" frente a este tipo de trastornos 20 .…”

“…Sin embargo, esta podría ser mayor, ya que en el estudio previo realizado en Chile 12 se detectó variantes clínicamente significativas en 25% de los pacientes, porcentaje que sube a cerca de 29%, si se consideran solo aquellos pacientes con cariotipo convencional normal. Otros parámetros, como el número de desbalances detectados, cromosomas comprometidos y tamaño de los desbalances, no se pueden comparar entre ambos estudios 12 , ya que solo 9 pacientes presentaron variantes clínicamen-te significativas detectadas por CMA y cariotipo convencional normal en el estudio previo 12 . Al realizar el análisis asociativo entre un resultado alterado por CMA y diversas características de los pacientes con cariotipo normal, detectamos una clara asociación entre el sexo del paciente y la posibilidad de encontrar una VLP/VP.…”

“…Existe un reporte previo chileno de Lay-Son y cols. 12 que determinó que 25% de los pacientes con AC mayores, dismorfias faciales y/o RDSM/DI presentaban un desbalance cromosómico que explicaba su sintomatología. Si bien este estudio reflejó resultados algo similares a lo reportado internacionalmente 11 , se realizó con una cohorte pequeña (n = 40), de los cuales 12,5% ya tenía una alteración cromosómica no bien caracterizada por cariotipo convencional.…”