Objetivo. Analizar la calidad microbiológica y actividad antibacteriana en 43 muestras de miel producida por Melipona beecheii, extraída durante las épocas de cosecha (enero a mayo del 2020 y 2021) y poscosecha (junio a octubre 2020) de meliponarios ubicados en selva baja caducifolia del Sureste de México. Materiales y métodos. La calidad microbiológica se determinó evaluando el contenido de mesófilos aerobios totales, coliformes, hongos, levaduras y anaerobios formadores de esporas. Para la actividad antibacteriana, se utilizó el ensayo de difusión en agar con pocillos utilizando concentraciones de miel al 5, 10, 20, 40 y 80%. Resultados. Se observó la presencia de mesófilos aerobios (83.7% de las muestras), coliformes (4.6%), mohos (20.9%) y levaduras (39.5%), con un máximo de 4.5x102, 2.5x10, 9.5x10 y 3.2x103 UFC/g, respectivamente. En ninguna muestra se observó la presencia de formas esporuladas de clostridios sulfito reductores. Con respecto a la actividad antibacteriana las mayores zonas de inhibición se registraron contra Staphylococcus aureus a una concentración de la miel al 80 y 40%, contrario a lo observado con Salmonella var. Typhimurium, Pseudomonas aureginosa y Escherichia coli, en donde la interferencia en el crecimiento bacteriano no fue tan evidente. Conclusiones. No obstante, el crecimiento de mesófilos y levaduras en la mayoría de las muestras, éstas presentaron actividad antibacteriana contra los patógenos referidos, lo cual puede ser atribuido a las interacciones entre microbioma, plantas, abejas y características fisicoquímicas de la miel.