Conhecer a Diversidade do Vírus da Hepatite C para Além da Frequência dos Genótipos em Amostras Analisadas entre 2009 e 2014 no Laboratório de Referência do Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge

Abstract

Acta Med Port 2015 Nov-Dec;28(6):695-701 RESUMOIntrodução: A identificação dos genótipos do vírus da hepatite C foi essencial para o prognóstico e tratamento dos doentes crónicos durante os últimos anos. Foram objetivos deste estudo conhecer a frequência de genótipos do vírus da hepatite C nos últimos seis anos, e revelar o contributo de um ensaio in-house para caracterização molecular do vírus. Material e Métodos:A genotipagem do vírus da hepatite C por LiPA foi realizada em 923 amostras, maioritariamente provenientes de indivíduos do sexo masculino. A subtipagem do vírus da hepatite C pelo ensaio in-house com alvo nas regiões Core/E1 e/ou NS5B foi efetuada em 112 amostras. Resultados: Observámos elevada prevalência do genótipo 1 (56,6%), sendo a frequência do subtipo 1a quatro vezes superior ao subtipo 1b. Todos os casos de genótipo 3 (27,5%) foram classificados em subtipo 3a. Nas infeções pelo genótipo 4 (12,9%), identificaram-se os subtipos 4a (65,5%), 4d (31%), 4b (1,7%) e 4c (1,7%). Foram identificadas a RF1_2k/1b, recombinantes intragenótipo 2 e potenciais infeções mistas na população analisada. Discussão: Os subtipos mais prevalentes, 1a e 3a, estão descritos como comuns em utilizadores de drogas injetáveis. Apesar da maioria das amostras analisadas corresponder a reclusos (78,4%), não podemos excluir eventuais comportamentos de risco associados ao consumo de drogas ilícitas. Conclusões: A prevalência elevada do subtipo 1a, a frequência e diversidade do genótipo 4 e a identificação de vírus geneticamente recombinados, sugerem alteração do padrão molecular vírus da hepatite C descrito no passado. O ensaio in-house implementado revelou ser útil para a correta classificação do vírus da hepatite C e melhoria do conhecimento sobre a diversidade do vírus em circulação no país. Palavra-chave: Diversidade Genética; Genótipos; Subtipos; Vírus da Hepatite C. ABSTRACT Introduction:The identification of genotypes was essential for the prognosis and treatment of hepatitis C virus chronic patients in recent years. The aims of the study were to know the frequency of genotypes diagnosed in the last six years at the laboratory, and reveal the contribution of an in-house assay for molecular characterization of viruses. Material and Methods:The genotyping of hepatitis C virus by LiPA was performed in 923 samples, mostly from male individuals. The subtyping of hepatitis C virus by an in-house assay to target regions in the Core/E1 and/or NS5B was performed in 112 samples. Results:We observed a high prevalence of genotype 1 (56.6%), with a frequency of subtype 1a four times higher compared to 1b. All cases of genotype 3 (27.5%) were subtype 3a. For the cases of genotype 4 (12.9%), it were identified subtypes 4a (65.5%), 4d (31%), 4b (1.7%) and 4c (1.7%). Recombinants intragenotype 2, the RF1_2k/1b, and mixed infections, were also identified. Discussion: The most prevalent subtypes (1a and 3a) obtained are usually described in injecting drug users. Although most of the samples analysed match to inmates (78.4%), we cannot excl...

Looking at the Molecular Target of NS5A Inhibitors throughout a Population Highly Affected with Hepatitis C Virus

“…The most common subtypes that infect these IDU were 1a (52.4%) and 3a (20.2%-21.4%), which is in accordance with previous studies [ 12 ]. These subtypes are also frequent in infected IDU in several European countries [ 10 ]. Of note, in the studied population, 32 individuals reported that they excessively consume alcohol, which negatively impacts on liver diseases and favors the progression of HCV infections [ 28 ], and at least 24 individuals had advanced fibrosis or cirrhosis, making them more likely to fail treatment with DAAs.…”

“…Although methadone programs have been successfully implemented, Portugal is one of the European countries that has reported higher rates of hepatitis C infection in drug users, varying from 60.0% to 80.0% [ 10 , 11 ]. This population is especially vulnerable because of their risky behaviors and usually do not adhere to conventional healthcare facilities for the treatment of hepatitis C. In a study conducted on a population of drug users attending a low-threshold methadone program in Lisbon, the prevalence of HCV antibodies was 67.6%, and RNA viral load was detected in 68.4% of the enrolled individuals [ 12 ].…”

Chronic Hepatitis C and comorbidities: real-world study to evaluate impact in outcomes after treatment with sofosbuvir-based regimens

“…The epidemiological pattern of HCV genotypes in Portugal reveals a GT 1 prevalence of approximately 53-60% followed by 25-34% for GT 3 and 7-9% for GT 4. GT 2 is the less frequent, with a prevalence not exceeding 2.3% [13,14].…”