In the last two decades, important developments in molecular biology have significantly improved our capacity to address questions in population biology, which could have an impact on our understanding of the epidemiology of plant pathogens. In turn, some of the molecular tools that are now available, in particular those based on the polymerase chain reaction, have made it possible to detect and monitor pathogens directly from the environment, by-passing the need for culturing. This has had a large impact in forest pathology, where hosts and pathogens often cover large ranges of latitude, longitude, and altitude. Genomics data as well are being generated in forest pathology, with fungal and tree genomes being completely sequenced. The integration of genomic and environmental data is a promising area of forest pathology, and this review will address some of the issues and potential future directions in this field.Résumé : Au cours des deux dernières décennies, d'importants développements en biologie moléculaire ont grandement amélioré notre capacité à aborder les questions de biologie des populations qui pourraient influer sur notre compréhension de l'épidémiologie des agents pathogènes des plantes. Pour leur part, certains des outils moléculaires maintenant disponibles, en particulier ceux basés sur l'amplification en chaîne de la polymérase, ont permis de détecter et surveiller des agents pathogènes directement dans l'environnement, éliminant la nécessité de les cultiver. Ceci a eu un impact considérable en pathologie forestière, où les hôtes et les agents pathogènes couvrent souvent de grands intervalles de latitude, de longitude et d'altitude. De plus, des données génomiques sont générées en pathologie forestière, des génomes de champignons et d'arbres étant complètement séquencés. L'intégration des données génomiques et environnementales est un domaine prometteur de la pathologie forestière, et la présente synthèse abordera quelques-unes des problématiques et des avenues dans ce domaine.Mots clés : génétique des populations, diagnostic, amplification en chaîne de la polymérase, génomique fongique, éta-blissement de profils de communautés, pathologie forestière.Hamelin: forest pathogens / molecular epidemiology / genomics 181