Convenient genotyping of nine bovine K-casein variants

Abstract

K-casein gene polymorphisms are of major importance in the dairy industry due to their association with different quality and productive traits (i.e., milk protein). Several methods for genotyping this gene have been proposed; however, none are focused on the simultaneous discrimination of nine K-casein variants. A strategy based on PCR-RFLP was designed to characterize nine K-casein variants (A, B, C, E, F 2 , G, H, I and J) and used to genotype three cattle populations: Gyrholando (3/8 Gyr x 5/8 Holstein), Charolais and Carora. The B variant was the most frequent in the Charolais and Carora breeds, with allelic frequencies of 0.60 and 0.59, respectively. In the Gyrholando breed, four variants were found, with the A variant being the most frequent and E and H the least. The genotyping strategy was effective in detection and differentiation of K-casein variants, and it is proposed for use in laboratories with minimal molecular biology equipment for genotyping and evaluation of the phenotypic effects of nine K-casein variants on milk production and quality.

Genetic polymorphism of kappa-casein gene in Friesian Holstein: a basic selection of dairy cattle superiority

“…Meanwhile, genetic improvement of quantitative traits is relatively slow (Lukac et al, 2013), therefore molecular approach study could be applied in the selection (Marker Assisted Selection/MAS). Identification of milk protein genetic polymorphism has interested many researchers (Contreras et al, 2011;Deb et al, 2014;Djedović et al, 2015) because of its possibility in association of milk protein genotypes and economically important traits in dairy cattle (Contreras et al, 2011). Study of kappa casein gene of Friesian Holstein cattle in Indonesia is needed to improve the genetic quality of milk performance (milk yield and milk content).…”

Investigación Asociada Con Las Evaluaciones Genéticas De Bovinos Productores De Leche en México

“…Diversas variantes alélicas de proteínas de la leche se han identificado en poblaciones CT, HO (Meza-Nieto et al, 2010), JE (Zepeda-Batista et al, 2014) y Gyrholando (Pacheco et al, 2011). Estos pocos estudios muestran la diversidad de las caseínas y el potencial de incluirse en programas de mejoramiento para características de calidad de leche (Zepeda-Batista et al, 2014).…”

“…Para β-lactoglobulina se han publicado diferentes frecuencias genotípicas entre razas; el genotipo BB fue más frecuente en CT mientras que el AB lo fue en HO, por lo que la leche de vacas CT podría presentar características fisicoquímicas y tecnológicas diferentes a la de Holstein (Meza-Nieto et al, 2010); en JE el alelo B presentó la mayor frecuencia (Zepeda-Batista et al, 2014). Para K-caseína, en la cual algunas de sus variantes alélicas han sido asociadas con diferentes características de calidad y producción en la industria láctea, en JE el alelo B fue el más común, lo que sugiere cierta selección genética indirecta de este alelo, debido a que los alelos relacionados con baja producción de sólidos (A y E) se encontraron con menores frecuencias que las del alelo B (Zepeda-Batista et al, 2014); mientras que en Gyrholando el alelo más frecuente fue A (0.83), seguido por el B (0.13) (Pacheco et al, 2011) Recientemente, la incorporación de los SNP (polimorfismos de un solo nucleótido) ha permitido incrementar exponencialmente el número de marcadores moleculares distribuidos a lo largo del genoma, evaluar el efecto de los SNP en características de importancia económica y utilizar las asociaciones SNP-fenotipo en ecuaciones para predecir el valor genómico de los animales (Meuwissen et al, 2001;2016). Aunque esta tecnología se comenzó a aplicar en bovinos HO, JE y SA en 2009 en los EE.…”