Objetivo: Identificar e analisar os sentimentos dos profissionais de saúde que exerceram suas atividades em uma Unidade Básica de Saúde (UBS) durante a pandemia de COVID-19, em um município de médio porte do Estado de Santa Catarina, em 2020. Métodos: Trata-se de um estudo qualitativo, desenvolvido com a equipe de saúde de uma UBS, localizada em um município de médio porte do estado de Santa Catarina, no mês de novembro de 2020. Para a coleta de dados, foram realizados três grupos focais com a participação de 23 profissionais de diferentes categorias. Os grupos focais foram conduzidos por meio de um roteiro orientador e as discussões foram audiogravadas e, posteriormente, transcritas. O material foi tratado por análise de conteúdo temática. O protocolo de pesquisa seguiu todos os requisitos éticos e foi aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa da Universidade Federal da Fronteira Sul (UFFS), por meio do parecer 4.301.348 de 20 de setembro de 2020 (CAAE: 37110520.7.0000.5564). Resultados: Ao analisar os sentimentos dos profissionais de saúde que atuaram na AB durante a pandemia de COVID-19, verificou-se que estes sentimentos impactaram a vida pessoal dos profissionais, o seu atendimento à comunidade e a vivência com a família. Pelos recortes de fala do material transcrito, emergiram cinco categorias empíricas compreendidas como sentimentos dos profissionais: sofrimento psíquico, pressão, medo, angústia e frustração. Conclusão: A pandemia de COVID-19 influenciou negativamente a saúde mental dos profissionais de saúde, uma vez que diversos sentimentos negativos foram evidentes nas falas profissionais.