During severe drought and low flows in the Otago Region of the South Island of New Zealand, increased bacterial contamination of rivers occurred in agricultural/ pastoral catchments due to greater stock use of waterways and the lack of dilution and flushing flows. Concentrations and loadings of nitrogen and phosphorus generally decreased due to the lack of rainfall, runoff and transport from diffuse sources. Other analytes, including dissolved solids and pH, did not change to any considerable degree and were quite spatially variable. Although the health of benthic macroinvertebrate communities can decrease with a lower diversity and fewer sensitive taxa, effects were not significant in most rivers. Algal blooms occurred in some locations, particularly in lowland agricultural catchments with low water velocities and little shade. The prolonged lack of flushing flows can be a significant problem. Fish kills occurred where they became stranded and isolated from the main flow and where there was a lack of deeper pool refuges. Temperatures in excess of 25°C can also result in isolated fish kills, but the duration of these high temperatures appears to be the most critical factor. Adverse effects from drought can be widespread and severe in some locations, but appear to be relatively short-lived with recovery occurring rapidly with increasing flows at most locations. This indicates a degree of resilience of rivers to drought and low flows with long-term impacts that are not severe.Key words rivers; low flows; drought; water quality; aquatic ecology; New Zealand Impacts de la sécheresse, puis restauration, sur les écoulements régionaux, la qualité de l'eau et l'écologie aquatique Bien que la santé des communautés de macro-invertébrés benthiques puisse être dégradée avec une diminution de la diversité et une sélection des taxons les plus robustes, les effets ont été peu significatifs dant la plupart des rivières. Des pullulations algales ont eu lieu en certains endroits, en particulier dans des bassins versants agricoles de plaines, présentant des vitesses d'écoulement faibles et peu d'ombre. L'absence durable de débit de chasse peut être un problème important. La mortalité des poissons a été forte là où ils se sont trouvé piégés et isolés des cours d'eau principaux et où les refuges profonds manquaient. Des températures supérieures à 25°C peuvent également causer la mort des poissons isolés, mais la durée de ces fortes températures apparaît comme le facteur critique principal. Les effets négatifs de la sécheresse peuvent être étendus et sévères en certains lieux, mais sont relativement éphémères dans la mesure où les qualités sont rétablies rapidement après la reprise des écoulements. Cela indique une forte resilience des rivières par rapport à la sécheresse et aux étiages, et donc des impacts à long terme qui ne sont pas sévères.