El diseño factorial completo de experimentos se ha utilizado con poca frecuencia para optimizar inmunoensayos, a pesar de sus ventajas en el ahorro de tiempo y recursos y sus resultados confiables. El objetivo de este trabajo fue optimizar un ELISA, que detecta anticuerpos IgA anti-RBD del SARS-CoV-2, mediante la aplicación de experimentos factoriales completos en varias etapas del ensayo. Se evaluaron las interacciones entre todos los factores y niveles en cada etapa, usando mezclas de leche materna, con alto y bajo contenido de anticuerpos, colectadas de puérperas vacunadas con la vacuna anti-COVID-19 Abdala. Se determinó la combinación óptima de factores y niveles para conformar el protocolo optimizado del ELISA, con el que se logró incrementar 4,67 veces la relación señal/ruido del ensayo respecto al protocolo no optimizado. Dado que este ELISA se aplica para verificar la presencia de anticuerpos anti-RBD del SARS-CoV-2 generados por la vacuna Abdala en la leche materna, el ensayo optimizado garantiza la detección en aquellas muestras con bajo contenido de anticuerpos, que probablemente tuvieran una señal de absorbancia cercana al blanco del ensayo si se aplicara el protocolo inicial no optimizado.