Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 16, 17 e 18 de suínos

Abstract

RESUMO -Objetivou-se com este trabalho realizar o mapeamento de Locos de características quantitativas (QTL) nos cromossomo 16, 17 e 18 de suínos e associar seus efeitos com características de desempenho. Utilizou-se uma população F2 proveniente do cruzamento de dois varrões da raça naturalizada brasileira Piau com 18 fêmeas de linhagem comercial (Landrace × Large White × Pietrain). A população foi genotipada para 11 marcadores microssatélites e o mapa de ligação específico dos marcadores para a população foi construído. Os marcadores de microssatélites foram considerados adequados para estudos de características quantitativas quando analisado o conteúdo de informação polimórfica (PIC). Para identificação do QTL, utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento e realizaram-se as análises por meio do programa QTLExpress. Foram detectados QTL não descritos na literatura para: número de tetas no cromossomo 16; peso aos 63 e aos 77 dias de idade no cromossomo 17; e peso aos 21 dias e idade de abate no cromossomo 18. Foram também identificados QTL já descritos em outras populações, como para peso aos 21 dias de idade no SSC16. As informações dos QTL significativos encontrados servem para futuros estudos de mapeamento fino com identificação de genes e para maior entendimento dos fenótipos produtivos de suínos. Palavras-chave: análise genômica, população F2, produção de suínos Detection of QTL for production traits on swine chromosomes 16, 17 and 18ABSTRACT -The objectives of this study were to map Quantitative Trait Loci (QTL) in chromosomes 16, 17 and 18 and to associate their effects with performance traits in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau sires with 18 crossbred dams (Landrace × Large White × Pietrain). The linkage map for this population was constructed after genotyping the animals for 11 microsatellite markers and scoring the genotype. Estimates of polymorphic information content (PIC) indicated that the microsatellite markers were appropriate for QTL analyses. Data were analyzed by interval mapping using the QTLEXPRESS program. New QTL were identified for teat number on SSC16, weight at 63 and 77 days of age on SSC17, weight at 21 days of age and slaughter age on SSC18. QTL already known in other populations were also identified for weight at 21 days of age on SSC16. The information of the significant QTL detected in this study is useful for future fine-mapping studies for identification of genes and to improve the knowledge about production traits in pig populations.

Estimação de parâmetros genéticos de uma população F2 de suínos

“…Zhang et al (1998) realizaram mapeamento dos locos de características quantitativas em gado de leite e observaram que vários cromossomos, em particular o seis; nove; 14; 20 e 26, apresentaram locos de características quantitativas associados a mais de uma característica. Estudos têm relatado a identificação de locos de características quantitativas em suínos para uma variedade de características (SILVA et al, 2003a;SILVA et al, 2003b;GONÇALVES et al, 2005;PIRES et al, 2005PIRES et al, e 2008PAIXÃO et al, 2008a;SILVA et al, 2008;EDWARDS et al, 2008a,b, SILVA et al, 2009PINTO et al, 2010, GONG et al, 2010, SOUZA et al, 2011. A maioria desses estudos utilizaram cruzamentos entre raças divergentes e focaram características de crescimento, carcaça, cortes de carcaça, órgãos internos e qualidade de carne.…”

Transcriptional profiling during foetal skeletal muscle development of Piau and Yorkshire-Landrace cross-bred pigs

“…The high fat content of Piau carcasses can be desirable in cross-breeding programs for improving meat quality traits such as marbling. Piau pigs have also recently been used for the development of a resource population to identify quantitative trait loci for growth, carcass merit, meat quality, and reproductive traits (Peixoto et al 2006;Silva et al 2008;Paixão et al 2008). Piau pigs have also recently been used for the development of a resource population to identify quantitative trait loci for growth, carcass merit, meat quality, and reproductive traits (Peixoto et al 2006;Silva et al 2008;Paixão et al 2008).…”

“…Historically, this breed was used for its fat and meat characteristics in the 1940s and 1950s in some genetic improvement programmes (Vianna 1956). Piau pigs have also recently been used for the development of a resource population to identify quantitative trait loci for growth, carcass merit, meat quality, and reproductive traits (Peixoto et al 2006;Silva et al 2008;Paixão et al 2008). However, investigation of Piau pigs at the transcriptome level has not been explored.…”

Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 9, 10 e 11 de suínos

“…A formação da população experimental e a coleta dos dados fenotípicos foram realizadas na Universidade Federal de Viçosa (UFV) no período de novembro de 1998 a julho de 2001, como descrito por Paixão (2008) e Silva (2009). Foi construída uma população F2, composta por 714 animais, proveniente do cruzamento entre dois varrões da raça naturalizada brasileira Piau e 18 fêmeas de linhagem desenvolvida na UFV pelo acasalamento de animais Landrace × Large White × Pietrain selecionados para desempenho.…”

“…O intervalo de confiança a 95% (IC95%) para a localização do QTL foi obtido usando a aproximação do Qui-quadrado ) ( 2 χ , conforme descrito por Pérez-Enciso et al (2000).…”