Detección de Iris yellow spot virus en cebolla cultivada en Tepalcingo, Morelos, México

Abstract

Detection of

Variabilidad y síntomas causados por Iris yellow spot virus en Nicotiana benthamiana

“…The S segment contains the N gene that encodes for capsid nucleoprotein that is commonly used to identify and classify tospoviruses, because of its degree of divergence , as well as to study geographic distribution and genetic diversity (Iftikhar et al, 2014). IYSV is widely distributed worldwide (Gent et al, 2006) but in Mexico it has been reported since 2012 on onion crops in the state of Morelos, where it causes a disease known as "yellow spot" with 100% incidence and more than 90% severity (Ramírez et al, 2016). In Morelos, two types of symptoms associated with IYSV have been observed and, for this reason, the objective of this research was to describe the symptoms caused by both isolates on Nicotiana benthamiana, and to find out if there are differences in the N segment of the genome and its phylogenetic relation with other isolates.…”

“…Onion leaf tissue was classified based on the severity of the symptoms observed, frozen with liquid nitrogen and stored at -80 °C. Nicotiana benthamiana plants were mechanically inoculated (Mandal et al, Fully Bilingual revista Mexicana de FITOPATOLOGÍA Mexican Journal oF PhytoPatholoGy incidencia de 100% y severidad superior al 90% (Ramírez et al, 2016). En esta entidad se han observado dos tipos de síntomas asociados a IYSV por lo que la presente investigación tuvo como objetivo describir los síntomas que ocasionan ambos aislamientos en Nicotiana benthamiana, conocer si hay diferencias en el segmento N del genoma y su relación filogenética con otros aislamientos.…”

“…González (2014) studied three Mexican isolates of TSWV and found that the difference in severity may be associated with changes in the amino acids in the Nsm and NSs proteins, as well as those in the intergenic regions (IGR). This may be due to the fact that the tospovirus NSs protein acts a gene silencing suppressor (Ocampo et al, 2016), and, for this reason, it would be necessary to analyze other genes in molecular characterization studies. The sequences obtained with the IYSV-KO4 and IYSV-KO6 primers of the typical and severe isolates tested ( Figure 2B) had 98 to 99% identity with the nucleoprotein of the capsid of IYSV gene N. The in silico analysis of the sequences obtained (data not shown) using the IYSV-KO4 and IYSV-KO6 primers of both isolates through RFLP with García et al, (2001) las cepas virales se consideran como un conjunto de aislamientos que mantienen propiedades similares como son el rango de hospedantes, capacidad de transmisión y similitud de secuencias de nucleóti-dos, entre otras.…”

“…González (2014) estudió tres aislamientos mexicanos de TSWV y encontró que la diferencia en la severidad podría estar asociada a cambios en los aminoácidos de las proteínas NSm, NSs y de las regiones intergénicas (IGR). Esto podría explicarse debido a que la proteína NSs de tospovirus actúa como un supresor del silenciamiento génico (Ocampo et al, 2016) por lo que sería necesario analizar otros genes en estudios de caracterización molecular. Las secuencias obtenidas con los iniciadores IYSV-KO4 e IYSV-KO6 de los aislamientos típicos y severos analizados (Figura 2B) tuvieron de 98 a 99% de identidad con la nucleoproteína de la cápside del gen N de IYSV.…”

“…Por otro lado, se encontró que aislamientos de IYSV del estado de Zacatecas correspondieron al genotipo IYSV NL relacionado con aislamientos de Norteamérica (Velásquez-Valle et al, 2016). Asimismo, en Zacatecas y Michoacán se ha reportado la presencia de lesiones cloróticas en hojas con pequeñas islas verdes en el centro (Velásquez-Valle et al, 2016;Ávila et al, 2017), mientras que en Morelos no se tiene registro de este tipo de síntoma (Ramírez-Rojas et al, 2016). Estos resultados sugieren la existencia de variantes de IYSV en Méxi-co que difieren biológica y molecularmente.…”