Detection of Acute Gastroenteritis Agents By Molecular Methods

Göktaş, Şafak; Gökmen, Ayşegül Aksoy; Şamlıoğlu, Pınar

doi:10.5799/jcei.413060

Cited by 3 publications

(2 citation statements)

References 14 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Çalışmamızda, semptomatik çocuk hastaların %2. Çocukluk çağı AGE epizodlarının yaklaşık %70'inin viral kaynaklı olduğu ve en sık saptanan etkenin rotavirüs olduğu bildirilmekle beraber gelişmiş ve gelişmekte olan ülkelerde viral, bakteriyel ve paraziter etkenlerin dağılımları değişkenlik gösterir [3,14,24,[38][39][40][41] . Çalışmamızda bir yıllık süre zarfında incelenen 8874 örneğin 1083 (%12.2)'ünde rotavirüs, 276 (%3.1)'sında HAdV antijenleri saptandı.…”

Section: Discussionunclassified

“…Metronidazolün ishalli olgularda gelişigüzel kullanılması antibiyotik direncine yol açmasının yanı sıra bağırsak disbiyozisine de neden olabilir [10,11] . Ülkemizde viral ve paraziter etkenler başta olmak üzere AGE epidemiyolojisi ve tanı yöntemleri hakkında çok sayıda yayın olmakla birlikte AGE'de antibiyotik kullanımının irdelendiği yayına rastlanmamıştır [12][13][14][15] . Bu çalışma ile AGE tanısıyla hastanemize başvuran hastalarda rotavirüs, HAdV, G. lamblia ve E. histolytica etkenlerinin varlığı ve buna karşılık hastalara metronidazol reçete edilip edilmediği araştırıldı.…”

Section: Introductionunclassified

See 1 more Smart Citation

Viral and Parasitic Gastroenteritis Agents and Metronidazole Treatment in Diyarbakir Children’s Hospital

Bacalan¹,

Çakir²,

Demirkaya³

et al. 2019

FLORA

View full text Add to dashboard Cite

Giriş: Akut gastroenterit (AGE) etkenleri, bölgelerin hijyen ve sanitasyon koşullarına ve hastaların yaş gruplarına göre değişkenlik gösterir. Rotavirüs her yaş grubunda en sık bildirilen etkendir, adenovirüs ise genellikle sporadik olgularda saptanır. Giardia lamblia dünyada yaygın olarak görülen, gastroenterit etkeni bir protozoondur. Giardiyaz insidansı çevre sanitasyon koşullarının yetersiz olduğu bölgelerde %40'lara yaklaşır. Amibik kolit, Entamoeba histolytica'nın neden olduğu, nadir görülen ancak tanısında sorunlar yaşanan bir parazit infeksiyonudur. Metronidazol, anaerop bakteri ve protozoonlara etkili sentetik 5-nitroimidazol türevidir. Amebiyaz ve giardiyaz tedavisinde yaygın olarak reçete edilen metronidazolün gereksiz kullanımı, intestinal disbiyozun yanı sıra antibiyotik direncine de neden olabilir. Bu çalışmada, AGE tanısıyla hastanemize başvuran hastaların dışkı örneklerinde rotavirüs, adenovirüs, G. lamblia ve E. histolytica varlığı ve hastalara metronidazol reçete edilme durumu araştırılmıştır.

show abstract

Section: Discussionunclassified

Section: Introductionunclassified

Viral and Parasitic Gastroenteritis Agents and Metronidazole Treatment in Diyarbakir Children’s Hospital

Bacalan¹,

Çakir²,

Demirkaya³

et al. 2019

FLORA

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Detection of Salmonella, Shigella and Campylobacter Species in Clinical Samples of Patients with Acute Gastroenteritis by Culture and Molecular Method

AVCİ

Kiraz

DURAN³

et al. 2022

Osmangazi̇ Journal of Medicine

View full text Add to dashboard Cite

Akut gastroenterit (AGE), tüm dünyada yaygın olarak görülen enfeksiyon hastalıkları arasındadır. Campylobacter, Salmonella, Shigella türleri AGE’nin bakteriyel etkenleri arasında ilk sıralarda bulunmaktadır. Bu çalışmada, laboratuvarımıza gönderilen gaita örneklerinde kültür yöntemi ve moleküler yöntemle Campylobacter, Salmonella ve Shigella sıklığını saptamak ve her iki yöntemin kıyaslanması amaçlanmıştır. 2019-2020 yılları arasında Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’ne ishal yakınması ile başvuran, ayaktan erişkin ve çocuk hasta örnekleri dahil edilmiştir. Dışkı örnekleri Campylobacter, Salmonella ve Shigella türlerinin tespiti için konvansiyonel kültür yöntemleri ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile çalışılmıştır. Çalışmamızda 400 (%77 yetişkin, %23 çocuk) hastaya ait dışkı örneği değerlendirilmiştir. Örneklerin kültür ile değerlendirilmesinde 14 örnekte (%3.5) etken saptanmış; 10’u (%2.5) Campylobacter spp., 4’ü (%1) Salmonella spp. olarak tiplendirilmiş, Shigella spp. izole edilememiştir. Kültür yöntemi ile Campylobacter spp. ve Salmonella spp. sıklığı çocuklarda sırasıyla %6.5 ve %2.2, yetişkinlerde %1.3 ve %0.7 olarak saptanmıştır. Örneklerin PZR ile değerlendirilmesinde 38 örnekte (%9.6) etken saptanmış; 33’ünde (%8.3) Campylobacter spp., 5’inde (%1.3) Salmonella spp. varlığı tespit edilmiş, hiçbir örnekte Shigella spp. saptanamamıştır. Kültürde üreme saptanan 14 dışkı örneğinin tamamında PZR yönteminde de aynı etken mikroorganizma tespit edilmiştir. 24 örnekte ise kültürde üreme saptanmayıp sadece PZR’de Campylobacter spp. veya Salmonella spp. saptanmıştır. Gaita kültürü AGE tanısında altın standart yöntem olmasına rağmen araştırmamız sonucunda PZR’nin hem hızlı sonuç vermesi hem de saptama oranının yüksek olması nedeniyle kültüre avantajlı olduğu görülmüştür. Bu nedenle moleküler yöntemlerin rutin tanıda kullanılmasının faydalı olacağı kanaatindeyiz.

show abstract

Bir Üniversite Hastanesinde Dışkı Örneklerinde Çalışılan Multipleks Pcr Bakteri Paneli Değerlendirilmesi

TOPCU¹,

Hasbek

Büyüktuna

et al. 2023

Hitit Medical Journal

View full text Add to dashboard Cite

Amaç:Enfeksiyöz gastroenterit salgınlarla seyredebilen küresel bulaşıcı hastalıktır. Akut gastroenteritlerin nedenleri arasında çok çeşitli bakteri, virüs ve parazitler bulunur. Çalışmamızda bölgemizdeki gastroenterit vakalarına neden olan bakteriyel etkenlerin dağılımının yanı sıra yaş ve mevsim gibi epidemiyolojik özelliklerini belirlemek, konvansiyonel metotlarla tespit edilmesi zor olan Campylobacter türlerinin multipleks gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle gerçek sıklığına ışık tutmak amaçlandı. Gereç ve Yöntem:Ocak 2016 ve Ağustos 2019 tarihleri arasında hastanemizin çeşitli kliniklerinden bakteriyel etkenlerin saptanması amacıyla mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen 7659 dışkı örneğinin bakteri paneli sonuçları geriye dönük olarak incelendi. Bulgular:Değerlendirilen olguların %21,7’si pozitif, %78,3’ü negatif saptandı. Pozitif örneklerin %92’sinde dört etkenden herhangi biri pozitif iken %7,9’unda 2 etken, %0,1’inde ise 3 etken birlikte pozitif saptandı. Tüm yaşlarda en çok tekli pozitif bulunan etken toplamda Campylobacter (%35,8) idi. Diğerleri sırayla Shiga toksin (%23,6 ), Shigella/ Enteroinvaziv E. coli (%22,3) ve Salmonella (%18,3) idi. Çocuklarda en sık Campylobacter (%43,6), erişkinlerde ise Shigella (%30,6 ) pozitif idi. Pozitiflik en sık yaz aylarında (%37,6) iken en az (%17,8) kış aylarında saptandı. Yaz aylarındaki en sık pozitif olan etken Campylobacter (%38,7), kış aylarında ise Shigella/ Enteroinvaziv E. coli (%39,7) olarak bulundu. Sonuç:Konvansiyonel yöntemlerle yapılan dışkı kültürlerinde özellikle Campylobacter türlerinin tanımlanmasında zorluklar yaşanmaktadır. Çalışmamız Campylobacter türlerinin neden olduğu gastroenteritlerin gerçek sıklığını belirlemek ve diğer etkenlerin bölgemizdeki dağılımının epidemiyolojik faktörlerden nasıl etkilendiğini göstermek açısından literatüre katkı sağlayacaktır. Diğer taraftan moleküler temelli yöntemler tanı açısından her ne kadar altın standart olarak kabul edilmese de, erken tanıya katkıda bulunarak ampirik tedaviye yön verebilir.

show abstract

Detection of Acute Gastroenteritis Agents By Molecular Methods

Cited by 3 publications

References 14 publications

Viral and Parasitic Gastroenteritis Agents and Metronidazole Treatment in Diyarbakir Children’s Hospital

Viral and Parasitic Gastroenteritis Agents and Metronidazole Treatment in Diyarbakir Children’s Hospital

Detection of Salmonella, Shigella and Campylobacter Species in Clinical Samples of Patients with Acute Gastroenteritis by Culture and Molecular Method

Bir Üniversite Hastanesinde Dışkı Örneklerinde Çalışılan Multipleks Pcr Bakteri Paneli Değerlendirilmesi

Contact Info

Product

Resources

About