Detection of Some Virulence Genes and Genetic Variations of Acinetobacter Baumannii

Mohammad, Ghada A.; Hussein, Noor

doi:10.51477/mejs.899167

Cited by 2 publications

(1 citation statement)

References 31 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Bu çalışmada 110 izolatta (%90.9) iutA geni saptanmıştır. Çeşitli çalışmalarda bu oran %19-23.8 olarak bildirilmiştir (2,23,24) . Bu çalışmada oranın çok yüksek olması tüm izolatların hastanede yatan hastalardan seçilmiş olması veya muhtemel benzer klonal dağılıma sahip olmasına bağlı olabilir.…”

Section: Discussionunclassified

Investigation of Virulence Genes of Nosocomial Acinetobacter baumannii Isolates

Zer,

Akboru,

Sağlam

et al. 2024

Turk Mikrobiyol Cemiy Derg

View full text Add to dashboard Cite

Acinetobacter baumannii cansız ortamlarda dahi aylarca canlı kalabilen önemli bir nozokomiyal patojendir. Son yıllarda A. baumannii'nin sahip olduğu birçok virülans faktörü tanımlanmıştır. Bu çalışma A. baumannii'nin çeşitli virülans faktörlerinin araştırılması ve bunların neden olduğu enfeksiyonlardaki klinik öneminin irdelenmesi amacı ile yapılmıştır. Yöntem: Çalışma çeşitli klinik örneklerden izole edilerek bakteriyoloji arşivinde bulunmakta olan A. baumannii izolatları ile yapılmıştır. Bakterilerin EUCAST standartlarına uygun olarak disk-diffüzyon yöntemi ile antibiyotik duyarlılık testleri çalışılmıştır. Daha sonra bu izolatların cvaC, iutA, csg, cnf1 genleri gerçek zamanlı PCR yöntemi ile çalışılmıştır. Bulgular: Çalışmaya 121 izolat dahil edilmiştir. İzolatlar en fazla endo-trakeal aspirat (54 örnek, %44.6) ve yara sürüntüsünden (42 örnek, %34.7) izole edildi. İzolatlara en etkin antibiyotik kolistin olarak bulunmuş olup dört izolatta (%3.3) kolistin direnci saptanmıştır. İzolatların tümünde en az bir virülans geni saptanırken, bir izolatta tüm virülans genleri saptanmıştır. En fazla 110 izolatta (%90.9) iutA geni, en az da dört izolatta (%3.3) cnf1 geni saptanmıştır. csgA ve cvaC genleri de sırasıyla 15 izolat (%12.4) ve 81 izolat (%66.9) da tespit edilmiştir. Sonuç: Siderofor ve bakteriosin genleri izolatların çoğunda izole edilmiş olmasına rağmen, kolonizasyondan ve direk hücresel sitotoksititeden sorumlu genlerin henüz daha az yaygın olduğu saptanmıştır.

show abstract

Section: Discussionunclassified

Investigation of Virulence Genes of Nosocomial Acinetobacter baumannii Isolates

Zer,

Akboru,

Sağlam

et al. 2024

Turk Mikrobiyol Cemiy Derg

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Biotyping and genotyping of seven strains of Cutibacterium acnes

Mahmood,

Mohammad

2024

Regul. Mech. Biosyst.

View full text Add to dashboard Cite

Bacterial typing is the process of distinguishing between different strains, it is essential for epidemiology, identifying source of infection and guiding treatment. This study aimed to detect the biotypes and genotypes for seven strains of Cutibacterium acnes obtained from the University of Mosul, already isolated from individuals with acne vulgaris in Mosul city (Iraq) and diagnosed by the molecular method based on 16S rRNA gene. Accuracy in biotyping depended on which type of the sugar (ribose, erythritol and sorbitol) was consumed by C. acnes, each sugar was placed separately in culture media with 1% concentration in the presence of phenol red to detect sugar fermentation. The C. acnes isolates were cultured anaerobically for 3 days at 37 ºC. The results showed that four biotypes (I, III, IV and V) emerged in our isolates indicated by the change in color of the medium from orange to yellow depending on the fermentable sugar. The distribution percentage of bacteria among these biotype was dominated by the V biotype (42.8%), while the III biotype was percentage (28.6%) and the I and IV biotypes each took up a lesser percentage (14.3%). It is worth mentioning that the II biotype didn’t appear at all in any of the isolates. For genotype, it was based on genes (16s rRNA, ATPase, atpD, Toxin Fic family, recA, and soda), DNA was extracted and special primers were used, then they were amplified by PCR technique, after electrophoresis, the resulting bands showed that the seven isolates of C. acnes were distributed into two genotypes only. One of them is I A2 which the isolate CS6 belonged to, another genotype is a new one- it is worth noting that it is prevalent in six isolates out of seven, and contains (16s rRNA, ATPase, atpD, recA, and sodA) genes, and because it is a new genotype that was unique to our isolates in this study, we called it IV genotype. The conclusion of this study is that the biotyping and genotyping of C. acnes differed from other typing in another countries, therefore, caution should be exercised in using the appropriate treatment depending on the prevailing condition in the country and not adhering to what is known theoretically regarding the causes of infections.

show abstract

Detection of Some Virulence Genes and Genetic Variations of Acinetobacter Baumannii

Cited by 2 publications

References 31 publications

Investigation of Virulence Genes of Nosocomial Acinetobacter baumannii Isolates

Investigation of Virulence Genes of Nosocomial Acinetobacter baumannii Isolates

Biotyping and genotyping of seven strains of Cutibacterium acnes

Contact Info

Product

Resources

About