Introdução: A análise das emissões dos combustíveis é de crucial importância para o entendimento da patogênese da morbi-mortalidade ocasionada pela poluição do ar. Objetivos: Analisar as emissões do combustível diesel e biodiesel (B50 e B100) sobre a toxicidade cardiovascular. Métodos: Camundongos Balb/C foram expostos a queima do diesel e/ou biodiesel durante uma hora. Os registros da freqüência cardíaca (FC), variabilidade da freqüência cardíaca (VFC) e da pressão arterial (PA) foram obtidas no tempo pré, 30 e 60 minutos após a exposição. Após 24 horas foram coletados o LBA, o sangue e a medula óssea para avaliar a inflamação pulmonar e sistêmica. Resultados: A queima do B100 reduziu as emissões da massa, fuligem, metais, CO, HPAs comparado as emissões do diesel e B50; ECG: RMSSD aumentou no grupo diesel (p < 0.05) comparado ao grupo controle, a BF aumentou no grupo diesel (p < 0.01) e B100 (p < 0.05) comparado ao grupo controle, a FC aumentou no grupo B100 (p < 0.05) comparado ao controle; sangue: o VCM aumentou no grupo B100 comparado aos grupos diesel (p < 0.01), B50 e controle (p < 0.001), o CHCM diminuiu no grupo B100 comparado aos grupos B50 (p < 0.001) e controle (p < 0.05), leucócitos aumentaram no grupo B50 comparado ao grupo diesel (p < 0.05), as plaquetas aumentaram no grupo B100 comparado aos grupos diesel e controle (p < 0.05), os reticulócitos aumentaram no grupo B50 comparado aos grupos diesel, controle (p < 0.01) e B100 (p < 0.05); medula óssea: os metamielócitos aumentaram nos grupos B50 e B100 comparado ao grupo diesel (p < 0.05); BAL: os neutrófilos aumentaram no grupo diesel e B50 comparado ao grupo controle (p < 0.05), os macrófagos aumentaram no grupo diesel (p < 0.01), B50 e B100 (p < 0.05) comparado ao grupo controle. Conclusão: O combustível biodiesel demonstrou ser tão tóxico quanto o diesel, promovendo um desequilíbrio no sistema nervoso autônomo, inflamação pulmonar e sistêmica. Background: Analysis of fuels emissions is crucial for understanding the pathogenesis of mortality due air pollution. Objectives: To assess cardiovascular toxicity of diesel and biodiesel (50 and 100%) particles. Methods: Mice were exposed to diesel or biodiesel during one hour, heart rate (HR), heart rate variability (HRV) and blood pressure (BP) were obtained immediately before, 30 and 60 minutes after exposure. After 24 hours: BAL, blood and bone marrow to evaluated inflammation were collected. Results: B100 decrease the emissions of mass, BC, inorganic, CO, PAHs and VOCs compared to B50 and diesel. ECG: RMSSD increased on diesel (p < 0.05) compared to control group; LF increased on diesel (p < 0.01) and B100 (p < 0.05) compared to control group; FC increased on B100 (p < 0.05) compared to control group. Blood: MCV increased on B100 compared to diesel (p < 0.01), B50 and control groups (p < 0.001), MCHC decreased on B100 compared to B50 (p < 0.001) and control groups (p < 0.05). Leucocytes increased on B50 compared to diesel group (p < 0.05); platelets increased on B100 compared to diesel and control grou...