Morphological and genetic evidences suggest that Rhamdia branneri and Rhamdia voulezi, currently considered synonymous of Rhamdia quelen, are in fact two valid species. Furthermore, in the taxonomic revision of R. quelen, no exemplars from the Iguaçu River were examined, which makes the synonymy doubtful. Considering the two species as valid, it was hypothesized that R. branneri and R. voulezi have ecomorphological differences, with the objective to verify if they can be considered ecologically distinct. Ecomorphological characterization was conducted using ecomorphological indices. For statistical analysis, a Principal Component Analysis (PCA), a Multiresponse Permutation Procedure (MRPP), and a Discriminant Analysis (DA) were performed. The ordination provided by the PCA evidenced ecomorphological separation, with R. branneri having morphological aspects related to benthic fishes, and R. voulezi having morphological characteristics related to pelagic and lentic habitats. The DA results confirmed the morphological tendencies found in the PCA, and the MRPP showed significant statistical differences between the ecomorphology of Rhamdia species. In this way, the initial hypothesis can be corroborated. These results allied to information about diet, genetics, and reproduction can be helpful for the elucidation of the taxonomic status of R. branneri and R. voulezi. Resumo: Evidências morfológicas e genéticas sugerem que Rhamdia branneri e Rhamdia voulezi, atualmente consideradas sinônimas de Rhamdia quelen, são, de fato, duas espécies válidas. Adicionalmente, na revisão taxonômica de R. quelen nenhum exemplar do rio Iguaçu foi examinado, o que torna a sinonímia duvidosa. Considerando as duas espécies como válidas, foi testada a hipótese de que R. branneri e R. voulezi possuem diferenças ecomorfológicas, com o objetivo de verificar se elas podem ser consideradas ecologicamente distintas. A caracterização ecomorfológica foi conduzida utilizando os índices ecomorfológicos. Para a análise estatística foram feitas Análise de Componentes Principais (ACP), Procedimento de Permutação Multiresposta (PPMR) e Análise Discriminante (AD). A ordenação proveniente da ACP evidenciou separação ecomorfológica, com R. branneri possuindo aspectos morfológicos relacionados a peixes bentônicos e R. voulezi possuindo características morfológicas relacionadas a habitats pelágicos e lênticos. Os resultados da AD confirmaram as tendências morfológicas encontradas na ACP, e o PPMR mostrou diferenças estatísticas significativas entre as espécies de Rhamdia. Dessa maneira, a hipótese inicial pôde ser corroborada. Esses resultados, aliados a informações sobre a dieta, genética e reprodução, podem ser úteis para a elucidação do status taxonômico de R. branneri e R. voulezi. Palavras-chave: endemismo, Heptapteridae, Rhamdia voulezi, Rhamdia branneri, Rhamdia quelen, ecomorfologia.