Este estudo concentra-se nos sistemas estuarinos tropicais de Mundaú-Manguaba (MMELS) e do Rio Paraíba do Sul (PSR), ambos no Brasil e afetados por práticas da monocultura da canade-açúcar e por urbanização. Os níveis de 17 hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs), 16 dos quais são classificados como poluentes prioritários para estudos ambientais pela US-EPA e o perileno (HPA biogênico) foram avaliados nos sedimentos superficiais para identificar fontes da poluição e determinar níveis base como estratégias para gerenciamentos futuros. O Σ16HPAs variou de 2,90 a 231,30 μg kg -1 em MMELS e de 87,10 a 9344,29 μg kg -1 no PSR. As relações entre HPAs isômeros sugeriram principalmente fontes de origem pirogênica.This study focuses on the tropical estuarine systems of Mundaú-Manguaba (MMELS) and Paraíba do Sul River (PSR), Brazil, affected by sugarcane monoculture practices and also urbanization. The levels of 17 polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), 16 of which are classified as priority pollutants by the US-EPA and perylene (a biogenic PAH) were measured in surface sediments to identify pollution sources and determine baseline data looking for future management strategies. The Σ16PAH ranged from 2.90 to 231.30 μg kg -1 in MMELS and from 87.10 to 9344.29 μg kg -1 in the PSR. PAH isomeric ratios suggested mainly pyrogenic input.