Diversity of Rhizoctonia solani Isolates of Rice Varieties of Ciherang, IR 64, Mekongga, and Situ Bagendit

Abstract

Padi (Oryza sativa) termasuk ke dalam komoditas penting di Indonesia. Salah satu penyakit penting pada tanaman padi ialah penyakit hawar pelepah yang disebabkan oleh Rhizoctonia solani. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui karakteristik dan kelompok anastomosis R. solani yang diisolasi dari tanaman padi varietas Ciherang, IR 64, Mekongga, dan Situ Bagendit; dan mengetahui keragaman genetiknya menggunakan primer universal, dan tingkat kekerabatannya. Penelitian dilaksanakan pada Oktober 2019 hingga Juli 2020 di Laboratorium Teknologi Pengendalian UGM. Pengambilan sampel dilaksanakan di Kecamatan Pandak, Bantul yang selanjutnya dilakukan isolasi dan pemurnian cendawan Rhizoctonia menggunakan medium agar-agar dekstrosa kentang. Isolat R. solani diklasifikasikan berdasarkan keragaman kultur, keragaman morfologi, jumlah inti sel, kemampuan anastomosis (AG), dan keragaman genetik. Analisis keragaman genetik dilakukan dengan PCR menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4. Berdasarkan pengamatan keragaman kultur dan keragaman morfologi diperoleh hasil yang bervariasi. Hasil pengamatan jumlah inti sel pada keseluruhan isolat berkisar antara 5 hingga 7 inti pada sel yang termasuk dalam kategori multinukleat. Pengamatan kelompok anastomosis (AG) pada 13 isolat yang digunakan masuk ke dalam kategori C3 (anastomosis sempurna). Analisis PCR diperoleh pita DNA dengan hasil sesuai target yaitu 600–750 pb. Hasil secara sikuensing diketahui bahwa 12 isolat R. solani menunjukkan kekerabatan yang tinggi dengan isolat AG-1 IA, kecuali pada isolat CH 3.

UJI EFIKASI FUNGISIDA UNTUK PENGENDALIAN PENYAKIT HAWAR PELEPAH (Rhizoctonia solani Khun.) PADA tanaman PADI SECARA IN VITRO DAN IN VIVO

“…Tanaman padi yang termasuk dalam genus (Oryza sativa L.) merupakan salah satu tanaman pangan yang penting di Indonesia ( (Manasikana et al, 2021)). Seiring dengan meningkatnya jumlah penduduk di Indonesia menyebabkan peningkatan kebutuhan bahan pangan yang paling utama yaitu bahan pangan berupa beras ( (Rohman & Maharani, 2018)).…”

“…Penurunan produksi padi dapat disebabkan oleh banyak faktor, seperti penyimpangan cuaca yang sulit diprediksi dan perkembangan beberapa penyakit yang semakin tinggi frekuensinya (Nuryanto, 2018). Rhizoctonia solani Khun., adalah cendawan penyebab penyakit hawar pelepah pada tanaman padi yang mengakibatkan penurunan hasil produksi padi (Manasikana et al, 2021)) Di Indonesia serangan penyakit hawar pelepah daun padi tingkat keparahan mencapai 6 -52 % sesuai dengan pengelolaan lingkungan pertanaman dan ketinggian tempat (Milati et al, 2021).…”

Revisión del estado actual de las investigaciones sobre Rhizoctonia solani Kühn

“…En el análisis determinaron 267 arns no codificantes y 11 592 genes, de estos, 2 488 están envueltos en las interacciones hospedante-patógeno. La diversidad genética de 13 aislamientos obtenidos de arroz con la enfermedad tizón de la vaina, causada por R. solani, fue determinada por caracterización molecular de la región its del adnr, encontrando alta relación genética con el aislamiento testigo ag-1 ia [5]. La diversidad genética de R. solani ag-3 pt fue evaluada por [12], donde se utilizaron 50 aislamientos provenientes de tubérculos de papa con síntomas de costra negra que, una vez sometidos a identificación molecular, permitieron confirmar que el ag-3 pt es el principal agente causal y origen etiológico de la costra negra en Colombia.…”

“…Análisis moleculares basados en pcr con cebadores específicos para ag-3 pt, rflp (restricción enzimática de la región ribosomal) y rams (amplificación aleatoria de marcadores microsatélites), fueron utilizados para determinar la diversidad genética al interior de ag-3 pt, reportando alta diversidad al interior de este grupo [12]. Manasikana et al [5] utilizaron cebadores universales its1 e its4 y pcr para realizar diagnóstico molecular y determinar las relaciones filogenéticas de aislamientos de R. solani procedentes de arroz, con lo que obtuvieron fragmentos de 600 a 700 pb, lo correspondiente a R. solani, y establecieron su relación genética con el ag-1a. Las regiones its1, its2 y 5.8S del rdna fueron amplificadas con los cebadores its1 y its4 para la identificación de R. solani ag-3 obtenido de muestras de suelo, utilizando pcr en tiempo real [41].…”

“…Rhizoctonia solani Kühn (teleomorfo Thanatephorus cucumeris) es un agente fitopatógeno que causa afectaciones en varios cultivos de importancia económica alrededor del planeta, entre estos, la papa [1], [2], la sandía [3], el tomate [4], el arroz [5], [6], el pimiento [7] y la soya [8]. Es por eso que, R. solani continúa siendo estudiado en diferentes partes del mundo, como lo reportan varios autores [1], [9]- [12].…”