-The RAPD technique is widely used to investigate the distinct genetic characteristics of the complex Bemisia tabaci (Gennadius), which is currently constituted of approximately 41 biotypes. The objective of this research was to characterize populations of whitefl y collected in crops of agricultural producing areas in São Luís, MA, like okra, beans and pepper, using RAPD molecular markers. Females from nine whitefl y populations were analyzed and compared with B. tabaci biotype B taken from poinsettia culture of Embrapa Genetic Resources and Biotechnology (Brasília, DF). Twelve out of the 20 primers tested produced specifi c band patterns suitable to confi rm that the evaluated specimens belong to the biotype B of B. tabaci, despite the high percentage of detected polymorphism. The analysis of the 96 RAPD molecular markers generated indicated that the populations on okra, beans and pepper were grouped according to the host cultures, sharing 80, 76 and 45% of genetic similarity, respectively, when compared with the control population of B. tabaci biotype B. A lower selective pressure was observed with the population of whitefl y collected on pepper and minor genetic variability in the whitefl y populations collected on okra and bean, when compared with the control population.KEY WORDS: Whitefl y, host culture, RAPD, genetic characterization RESUMO -A técnica de RAPD é amplamente empregada para investigar características genéticas distintas dentro do complexo Bemisia tabaci Gennadius, atualmente constituído de aproximadamente 41 biótipos. O objetivo desta pesquisa foi caracterizar populações de mosca-branca coletadas em culturas agrícolas do município de São Luís, MA, como quiabo, feijão e pimentão, utilizando marcadores moleculares RAPD. Fêmeas de nove populações de mosca-branca foram analisadas e comparadas com o biótipo B de B. tabaci proveniente de cultura de poinsétia da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (Brasília, DF). Dos 20 iniciadores utilizados, 12 produziram padrões de bandas específi cas, que permitiram confi rmar que os espécimes avaliados pertencem ao grupo do biótipo B de B. tabaci, apesar da alta percentagem de polimorfi smo detectado. Com os 96 marcadores moleculares RAPD gerados foi construído um dendrograma, que mostrou que as populações de quiabo, feijão e pimentão foram agrupadas de acordo com as culturas hospedeiras. A matriz de similaridade genética entre as populações de B. tabaci mostrou 80, 76 e 45% similaridade genética entre as populações das culturas de quiabo, feijão e pimentão, respectivamente, quando comparadas com a população controle de B. tabaci biótipo B. Foi também observada menor pressão de seleção na população de mosca-branca coletada em pimentão e menor variabilidade genética nas populações de mosca-branca coletadas em quiabo e feijão, quando comparadas com a população controle.