Dynamics of microbial population size in rhizosphere soil of Monsanto's Cry1Ac cotton

Zhang, Y. J.; Xie, Ming; Peng, Deliang; Zhao, Jing; Zhang, Z. R.

doi:10.17221/770/2015-pse

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“…• Valores entre 10 9 -10 11 y ~10 12 copias del gen ARNr 16S g -1 de peso seco en rizosfera de Cajanus cajan y algodón, respectivamente (Sharma et al, 2020;Zhang et al, 2016).…”

Section: Capítulounclassified

“… El suelo y la rizosfera se caracterizaron por una mayor abundancia poblacional bacteriana (10 13 -10 14 copias del gen ARNr 16S g -1 de peso seco), en comparación con las muestras de endosfera (10 8 -10 10 copias del gen ARNr 16S g -1 de peso seco) de plantas de tomate, independientemente del establecimiento en el cual se cultivaron las plantas (Tabla 2.3.3a). Si bien no se encontraron reportes que utilicen esta técnica para cuantificar las comunidades bacterianas asociadas a plantas de tomate, existe información de otras especies vegetales (trigo, arroz, frutilla, garbanzo, pasturas de gramíneas, entre otros) que evidencia el mismo comportamiento descripto anteriormente: suelos y rizosferas con mayores densidades poblacionales -que varían entre 10 10 y ~10 13 copias del gen ARNr 16S g -1 -, y endosferas y filosferas de diferentes órganos vegetales (raíces, hojas, flores, frutos) con menores densidades poblacionales, entre 10 6 -10 8 copias del gen ARNr 16S g -1 (Acuña et al, 2016;Azarbad et al, 2022;Chen et al 2022;Olimi et al, 2022;Sharma et al, 2020;Zhang et al, 2016).…”

Section: Discusión Generalunclassified

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Microbiota bacteriana asociada al cultivo de tomate: caracterización y selección de bacterias promotoras del crecimiento vegetal

Vio¹,

Luna²

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En Argentina el cultivo de tomate es el segundo cultivo hortícola más producido y que ocupa el primer lugar entre las hortalizas cultivadas bajo cubierta en invernadero, concentrando su producción principalmente en el Cinturón Hortícola de La Plata. Este es un cultivo con considerables exigencias nutricionales que normalmente son suplidas por fertilizantes químicos, sumado al tratamiento común con fitosanitarios ya que presentan numerosas plagas y enfermedades. En los últimos años, el acelerado proceso de degradación del suelo debido a la implementación de prácticas agrícolas intensivas ha llevado a una necesidad de investigación y desarrollo de prácticas más sustentables. Teniendo en cuenta que las plantas están naturalmente colonizadas por comunidades bacterianas ubicadas en la rizosfera, la filosfera y endosfera, y que muchas de estas bacterias juegan papeles cruciales en la salud y el crecimiento de las plantas, se enfocó el interés en el conocimiento de la microbiota bacteriana asociada al cultivo de tomate con el objetivo general de poder aprovechar sus servicios ecosistémicos para proporcionar soluciones sustentables a los desafíos agrícolas actuales. Aún es escasa la información en relación a la microbiota de órganos tanto aéreos y subterráneos así como de rizosfera y de suelo asociados a las plantas de tomate cultivadas en el CHP en condiciones de producción, en particular de la var. elpida (variedad utilizada por los productores de la región), que resultó de interés como planta modelo para el estudio ecológico y de bioprospección de las comunidades bacterianas asociadas, haciendo uso de técnicas dependientes e independientes de cultivo (moleculares). Los resultados proporcionaron una caracterización completa y detallada de las comunidades bacterianas asociadas a rizosfera y endosfera de raíz, tallo y fruto de plantas de tomate variedad elpida, encontrando que la abundancia, estructura, composición y funcionalidad de las comunidades bacterianas asocia-das tuvieron como principal determinante al microhábitat. Las prácticas agrícolas continuas comúnmente empleadas en la actividad hortícola del CHP (labranza refinada, fertilización química/fertirriego, uso de agroquímicos, enmiendas orgánicas, monocultivo) tuvieron impactos tanto negativos como positivos sobres las características físico-químicas del suelo, cuyo resultado combinado no se tradujo en la modificación de las propiedades emergentes, sino en el cambio en los perfiles taxonómicos de las comunidades bacterianas de suelo y rizosfera. Además, los cambios en las comunidades bacterianas de suelo y rizosfera por efecto del sitio, no evidenciaron modificaciones en las comunidades de endosfera de plantas cultivadas en cada uno de ellos, sugiriendo que las plantas de tomate son un hospedero robusto de sus comunidades bacterianas de endosfera. Por otro lado, los estudios de bioprospección evidenciaron que las plantas de tomate son un reservorio natural de diversas bacterias cultivables, muchas de las cuales pudieron ser aisladas y caracterizadas, exhibiendo múltiples rasgos PGPB: los aislamientos bacterianos seleccionados demostraron su efecto antagonista y promotor del crecimiento vegetal en ensayos in vivo.

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“…• Valores entre 10 9 -10 11 y ~10 12 copias del gen ARNr 16S g -1 de peso seco en rizosfera de Cajanus cajan y algodón, respectivamente (Sharma et al, 2020;Zhang et al, 2016).…”

Section: Capítulounclassified

Section: Discusión Generalunclassified

Microbiota bacteriana asociada al cultivo de tomate: caracterización y selección de bacterias promotoras del crecimiento vegetal

Vio¹,

Luna²

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Monitoring changes in the actinobacterial field communities present in the rhizosphere soil of a transgenic cotton producing Cry1Ab/Ac proteins

Zhang

Xie

et al. 2017

Crop Protection

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Putative Nitrogen-Fixing Bacteria Associated With the Rhizosphere and Root Endosphere of Wheat Plants Grown in an Andisol From Southern Chile

et al. 2018

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Acidic ash derived volcanic soils (Andisols) support 50% of cereal production in Chile. Nitrogen (N) is essential for cereal crops and commonly added as urea with consequent environmental concerns due to leaching. Despite the relevance of N to plant growth, few studies have focused on understanding the application, management and ecological role of N2-fixing bacterial populations as tool for improve the N nutrition of cereal crops in Chile. It is known that N2-fixing bacteria commonly inhabits diverse plant compartments (e.g., rhizosphere and root endosphere) where they can supply N for plant growth. Here, we used culture-independent and dependent approaches to characterize and compare the putative N2-fixing bacteria associated with the rhizosphere and root endosphere of wheat plants grown in an Andisol from southern Chile. Our results showed significantly greater bacterial loads in the rhizosphere than the root endosphere. Quantitative PCR results indicated that the copy number of the 16S rRNA gene ranged from 1012~1013 and 107~108 g−1 sample in rhizosphere and root endosphere, respectively. The nifH gene copy number ranged from 105~106 and 105 g−1 sample in rhizosphere and root endosphere, respectively. The total culturable bacteria number ranged from 109~1010 and 107~108 CFU g−1 sample in rhizosphere and 104~105 and 104 CFU g−1 sample in root endosphere using LB and NM-1 media, respectively. Indirect counts of putative N2-fixing bacteria were 103 and 102~103 CFU g−1 sample in rhizosphere and root endosphere using NFb medium, respectively. Sequencing of 16S rRNA genes from randomly selected putative N2-fixing bacteria revealed the presence of members of Proteobacteria (Bosea and Roseomonas), Actinobacteria (Georgenia, Mycobacterium, Microbacterium, Leifsonia, and Arthrobacter), Bacteroidetes (Chitinophaga) and Firmicutes (Bacillus and Psychrobacillus) taxa. Differences in 16S rRNA and putative nifH-containing bacterial communities between rhizosphere and root endosphere were shown by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). This study shows a compartmentalization between rhizosphere and root endosphere for both the abundance and diversity of total (16S rRNA) and putative N2-fixing bacterial communities on wheat plants grown in Chilean Andisols. This information can be relevant for the design and application of agronomic strategies to enhance sustainable N-utilization in cereal crops in Chile.

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Dynamics of microbial population size in rhizosphere soil of Monsanto's Cry1Ac cotton

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Microbiota bacteriana asociada al cultivo de tomate: caracterización y selección de bacterias promotoras del crecimiento vegetal

Microbiota bacteriana asociada al cultivo de tomate: caracterización y selección de bacterias promotoras del crecimiento vegetal

Monitoring changes in the actinobacterial field communities present in the rhizosphere soil of a transgenic cotton producing Cry1Ab/Ac proteins

Putative Nitrogen-Fixing Bacteria Associated With the Rhizosphere and Root Endosphere of Wheat Plants Grown in an Andisol From Southern Chile

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