Corn starches were isolated using three different methods: water steeping, alkaline steeping, and acid steeping. The effects on their structural, micro structural, thermal, and chemical properties were evaluated, with especial emphasis in the alkaline process that is close related to the nixtamalization process. The isolation method influences the amylose content, crystallinity, and enthalpy of the starch granules. Scanning electron microscopy showed that the isolation method produced changes on the surface of the granules, and in some cases there were holes on the surface. Method 2 (the alkaline method) produces the starch granules with low protein and fat content and there was an increase in the enthalpy for this method, that can be explained in terms of thermodynamics by the increase of particles into the starch granules, which was confirmed by an increase in the ash content. A negative correlation between these variables was found (r ¼ 70.99), while a positive correlation between enthalpy and amylose content was also found (r ¼ 1).Keywords: corn starch; isolation method; functional properties of starch; amylose; amylopectin Almidones de maı´z fueron aislados por tres diferentes me´todos: usando reposo en agua, reposo alcalino y reposo a´cido. Se evaluaron los efectos de estos me´todos sobre las propiedades estructurales, microestructurales, te´rmicas y quı´micas en los gra´nulos de almido´n. Los resultados mostraron que los me´todos de obtencio´n de almido´n tienen fuerte influencia en el contenido de amilosa en los almidones aislados, ası´como en su estructura cristalina obtenida mediante difraccio´n de rayos X, ası´como cambios en la superficie de los gra´nulos observados por microscopia electro´nica de barrido, se tiene especial e´nfasis en el proceso alcalino, por que es cercano al proceso de nixtamalizacion. El me´todo alcalino produjo gra´nulos de almido´n con bajo contenido de proteı´na y grasa. En el caso del tratamiento alcalino, en te´rminos termodina´micos, el incremento en la entalpia tambie´n puede ser explicado por el incremento de las partı´culas dentro de los gra´nulos de almido´n, resultado que es confirmado por el incremento del contenido de cenizas. Finalmente, se encontro´una correlacio´n (r ¼ 70,99) tomando en cuenta los valores de cristalinidad y entalpia, y una correlacio´n positiva (r ¼ 1) entre entalpia y contenido de amilosa.Palabras clave: almido´n de maı´z; me´todo de aislamiento; propiedades funcionales de almido´n; amilosa; amilopectina