La epilepsia es una enfermedad neurológica crónica que podría afectar indirectamente la salud bucal; siendo necesario que los odontólogos estén familiarizados con las necesidades específicas de estos pacientes. Por ello, el propósito de esta investigación fue evaluar los factores asociados al nivel conocimiento sobre el manejo asistencial de pacientes con epilepsia, en estudiantes odontólogos peruanos. Materiales y métodos Este estudio analítico, observacional, transversal y prospectivo, evaluó 312 estudiantes de Estomatología de una universidad peruana de febrero a abril del 2022. Se utilizó un cuestionario validado de 20 preguntas cerradas de opción múltiple para medir el nivel de conocimiento sobre el manejo estomatológico en pacientes epilépticos. Se utilizó un modelo logit para evaluar la influencia de las variables: género, edad, año de estudio, estado civil, lugar de procedencia y zona de residencia, con el nivel de conocimiento de los estudiantes, considerando un nivel de significancia de p<0.05. Resultados El 28.8%, el 36.2% y el 34.9% del total, presentaron un nivel de conocimiento malo, regular y bueno; respectivamente, sobre el manejo estomatológico del paciente epiléptico. Por otro lado, se pudo observar que el ser mujer (OR = 0.44, IC: 0.26 0.75) y ser estudiante de tercer (OR = 0.39, IC: 0.21 0.74) y cuarto año (OR = 0.43, IC: 0.23 0.89) constituyó un factor protector frente a l conocimiento malo del manejo estomatológico del paciente epiléptico; mientras que el ser de procedencia capitalina constituyó un factor de riesgo. Por último, la edad, el estado civil y la zona de residencia de los estudiantes no fueron considerados factores influyentes (p>0.05). Conclusión La mayoría de los estudiantes mostraron un nivel de conocimiento malo y regular, sobre el manejo estomatológico del paciente epiléptico; siendo sus factores influyentes el sexo, el año académico y el lugar de procedencia.