Os metais pesados se encontram amplamente distribuídos no meio ambiente, podendo ser advindos de origens naturais, industriais, agrícolas e outras fontes. O acúmulo desses metais em corpos hídricos está relacionado a diversas questões ambientais, sobretudo a respeito da qualidade da água para consumo. Sendo assim, o objetivo geral desse estudo foi isolar, identificar e caracterizar bactérias tolerantes aos metais níquel e cobalto presentes em amostras de água bruta e no sedimento do Rio Traíras - Niquelândia (GO). Foram obtidos 68 isolados bacterianos, sendo estes submetidos ao método de microdiluição para determinar a concentração inibitória mínima (CIM). Com base nos resultados encontrados, foram selecionados 12 isolados bacterianos, que apresentaram maior e menor tolerância, sendo estes classificados de acordo com suas características microscópicas e tintoriais. De acordo com os resultados observou-se a tolerância das bactérias isoladas a altas concentrações dos metais, sugerindo seu uso como ferramenta biotecnológica para a remediação de áreas contaminadas.