A área da micologia médica apresenta um desafio diagnóstico e terapêutico para profissionais da saúde. Diante das infecções fúngicas invasivas, a educação continuada pode desenvolver competências importantes para o diagnóstico e tratamento correto. O objetivo do trabalho foi verificar a percepção dos estudantes da área da saúde quanto ao curso de extensão em micologia médica como ensino complementar na graduação, ofertado na modalidade a distância em tempos da COVID-19. A aplicação de questionário foi realizado por meio de formulário on-line composto por 21 pressupostos objetivos. As respostas seguiram a escala de Likert, visando avaliar aspectos quantitativos e qualitativos do curso. Os dados coletados foram analisados por estatística descritiva. Após a conclusão do curso, os estudantes concordaram que tiveram seu conhecimento teórico-prático ampliado, aumentando sua confiança em enfrentar os desafios profissionais que envolvem infecções fúngicas. Os estudantes aprovaram a estrutura do curso concordando com as proposições com alto Ranking Médio (RM) (entre 4,58 e 5,00). No total, 88% dos estudantes afirmaram que o tema "Infecções Fúngicas" não foi abordado em seus cursos de graduação com o mesmo detalhamento como ocorreu neste curso de extensão. Quando questionados se o aproveitamento e a execução do curso seriam melhores se fosse realizado presencialmente, um cenário heterogêneo de respostas foi observado (RM = 3,50). A micologia é uma área que merece atenção dentro da microbiologia médica e o curso de extensão pode ser uma alternativa eficiente de estratégia complementar para tornar os estudantes mais aptos a enfrentar os desafios profissionais relacionados às infecções fúngicas.