Este estudio tuvo como propósito analizar la importancia de las herramientas digitales para el logro de la indagación científica, una competencia clave en el aprendizaje de los estudiantes. Se consideró el uso de tecnologías basadas en e-learning, m-learning y b-learning como las principales herramientas para promover la indagación científica mediante procesos sincrónicos y asincrónicos de enseñanza en entornos digitales. El trabajo se desarrolló a la luz del paradigma interpretativo, con enfoque cualitativo y diseño documental. Los resultados tienen un alcance explicativo. La revisión de las publicaciones académicas permitió verificar que las herramientas más utilizadas son las plataformas educativas basadas en Google Workspace, aplicaciones para atender diversos casos de uso (Google Drive, Google Docs, Google presentaciones, Google Sites), que contribuyen notablemente al proceso educativo mediante la metodología de la indagación. Finalmente, se establecieron las estrategias para desarrollar la indagación, considerándose las propuestas de un entorno virtual, semipresencial y presencial para el trabajo colaborativo, el estudio de casos, el aprendizaje basado en proyectos y la autorregulación de los aprendizajes. Ergo, las herramientas digitales son aliados importantes para la indagación en entornos educativos con estudiantes de educación secundaria.