El propósito de este estudio es investigar la capacidad antibacteriana de las nanopartículas de plata (AgNPs), biosintetizadas con extractos de queñua (Polylepis racemosa), en el afluente de la Planta de Tratamiento de Aguas Residuales (PTAR) del departamento de Cusco, Perú. Los extractos de queñua se prepararon mediante maceración, utilizando como solventes agua destilada y una mezcla hidroetanólica al 50%. La biosíntesis se realizó mezclando AgNO3 0,1 M con los extractos preparados, después se estudió el efecto del pH de biosíntesis, la temperatura y el porcentaje de concentración de etanol sobre el tamaño de las AgNPs. Los resultados revelaron que las condiciones óptimas para obtener partículas con tamaños hidrodinámicos de 58,68 nm, y estables después de 11 semanas de la biosíntesis, fueron cuando se usó extracto acuoso con pH de 10 y temperatura de 20 °C. Se evaluó la actividad antibacteriana de las AgNPs en 500 mL de agua residual con una carga inicial de 33 × 106 NMP/100 mL de coliformes totales y termotolerantes, los hallazgos indicaron que las dosis de AgNPs erradicaron casi el 100% de estos contaminantes, lo que sugiere que las AgNPs son un potencial agente antibacteriano.