Research on coral reef community structure suggests that fine spatial-temporal stochasticity drives biodiversity patterns in this tropical marine ecosystem. The combination of a coral colony and its zooxanthella, or holobiont, should therefore be used as the community indivisible units to better understand this structure. Research in zooxanthellae (Symbiodinium) diversity has allowed the identification of specific or generalist host associations. The distribution of specific symbionts depends on both the host identity and the environmental conditions. This study determined the identity on these symbionts within hard corals communities (Scleractinia and Milleporina) at 27 sites on the upper slope habitat (mixed zone) in Cartagena, Colombia (Southwestern Caribbean Sea). Zooxanthellae identification was made with RFLPs analysis (18S, SSU, rDNA), DGGE, and DNA sequencing (ITS2, rDNA). Different combinations of coral species and their specific Symbiodinium types (holobionts) were determined as different ecological units. Taking each holobiont as a variable, a cluster community structure analysis was made and compared to the pattern obtained from using coral species alone. Different site groupings occurred for holobionts and species, where higher similarities were found using holobionts. O. annularis and O. faveolata, two dominant coral species, formed independently different Symbiodinium associations, depending on depth. Their symbiont preference can be under higher selection pressure than previously thought, if they act as different ecological units. © Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat. 2016.Key words: Zooxanthellae, community structure, holobiont, Caribbean Sea, coral reefs, Symbiodinium, Scleractinia.
Conjuntos de holobiontes de especies dominantes de corales (Tipos de Symbiodinium y especies de corales) moldean la estructura comunitaria en arrecifes coralinos del Caribe ResumenInvestigaciones de la estructura de comunidades coralinas sugieren que escalas espacio temporales cortas son responsables de patrones en ecosistemas marinos tropicales. La combinación coral y su zooxantela, u holobionte, puede ser la entidad ecológica modificada por estos factores. La estructura de la comunidad de corales podría ser mejor entendida usando el holobionte como unidad indivisible de la comunidad. Investigaciones recientes en diversidad de zooxantelas (Symbiodinium spp.) han revelado asociaciones de tipo específicas, así como generalistas dependiendo del hospedero. Su distribución depende tanto del hospedero como de las condiciones ambientales. Este estudio determino la identidad molecular de estos simbiontes en comunidades de corales duros (Scleractinia y Milleporina) en 27 localidades en el talud arrecifal superior (zona mixta) en Cartagena, Colombia. La identificación de zooxantelas se realizó mediante análisis de RFLPs (18S, SSU, rDNA, por sus siglas en inglés), DGGE y secuenciación de ADN (ITS2, rDNA). Se encontró variación intra e intercolonial, dependiendo de la especie del hospedero. Se determinaron diferentes ho...