Los lagos desempeñan un papel fundamental en la ecología global, ya que afectan los ciclos del agua, y contribuyen a la biodiversidad. Este estudio evaluó el estado trófico de la Laguna Yahuarcocha mediante el software AQUATOX. Se llevó a cabo un muestreo inicial para estimar los parámetros y valores iniciales del modelo, y posteriormente, se realizó un monitoreo (septiembre a diciembre) a través de ocho muestreos. Los parámetros considerados fueron la profundidad del disco Secchi, fósforo total y concentraciones de clorofila. Se utilizó el error cuadrático medio y el error relativo para comparar y validar los resultados del modelo. Finalmente, se evaluó el potencial de la macrófita Myriophyllum para mejorar el estado trófico de la laguna. La laguna evaluada mostró un estado hipereutrófico para el fósforo total y eutrófico para la clorofila a y la profundidad del disco Secchi. A pesar de los intentos de modelado, el modelo no alcanzó una validación aceptable. La aplicación de biorremediación con la planta macrofita Myriophyllum presentó mejoras significativas, de un estado hipereutrófico a eutrófico para el fósforo total y la clorofila, mientras que para la profundidad del disco Secchi, presentó de un estado eutrófico a mesotrófico.