Exon deletions of SPG4 are a frequent cause of hereditary spastic paraplegia

Depienne, Christel; Fédirko, Estelle; Forlani, Sylvie; Cazeneuve, Cécile; Ribaı̈, Pascale; Feki, Imed; Tallaksen, Chantal; Nguyen, Karine; Stankoff, Bruno; Ruberg, Merle; Stevanin, Giovanni; Dürr, Alexandra; Brice, Alexis

doi:10.1136/jmg.2006.046425

Cited by 106 publications

(112 citation statements)

References 11 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Mutations in the ATL1 and REEP1 gene had previously been excluded by direct sequencing and multiplex ligationdependent probe amplification (MLPA) at the following frequencies: SPG3A sequencing in 55% of cases, SPG3A MLPA in 85% and SPG31 (sequencing and MLPA) in 84% of cases. 7,9,[12][13][14] The HSP phenotype was pure in 125 (57%) and complicated in 95 (43%) patients. Informed consent was obtained in all cases.…”

Section: Patients and Methods Patientsmentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

A total of 220 patients with autosomal dominant spastic paraplegia do not display mutations in the SLC33A1 gene (SPG42)

et al. 2010

View full text Add to dashboard Cite

The most frequent causes of autosomal dominant (AD) hereditary spastic paraplegias (HSP) (ADHSP) are mutations in the SPAST gene (SPG4 locus). However, roughly 60% of patients are negative for SPAST mutations, despite their family history being compatible with AD inheritance. A mutation in the gene for an acetyl-CoA transporter (SLC33A1) has recently been reported in one Chinese family to cause ADHSP-type SPG42. In this study, we screened 220 independent SPAST mutationnegative ADHSP samples for mutations in the SLC33A1 gene by high-resolution melting curve analysis. Conspicuous samples were validated by direct sequencing. Moreover, copy number variations affecting SLC33A1 were screened by multiplex ligation-dependent probe amplification assay. We could not identify potentially disease-causing mutations in our patients either by mutation scanning or by gene dosage analysis, as for the latter specific positive controls are not available to date. As our sample represents ADHSP patients for whom SPAST mutations and almost in all cases ATL1 and REEP1 mutations had been excluded, we consider SLC33A1 gene mutations as being very rare in a European ADHSP cohort, if present at all. To date, as SPG42 has still not been identified in a second, unrelated family, systematic genetic testing for SLC33A1 mutations is not recommended.

show abstract

Section: Patients and Methods Patientsmentioning

confidence: 99%

“…17 This mutational class is frequent (B20%) in SPG4 and is also relevant for SPG31. 7,14,19 Both forms are associated with pure ADHSP. To assess quantitative changes in SLC33A1 copy number, MLPA was used but no rearrangements were identified.…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

A total of 220 patients with autosomal dominant spastic paraplegia do not display mutations in the SLC33A1 gene (SPG42)

et al. 2010

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…(11)(12)(13)(14) In our study, we detected a novel 14-bp heterozygous deletion (c.1630-1643delTACTCAGGAAGTGA) in exon 15 of the SPAST gene, which led to a frameshift mutation with a premature stop codon.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 92%

“…(9) To date, more than 257 SPAST mutations have been reported, (10) including missense, nonsense or splice site mutations, small insertions or deletions, and large duplications or deletions. (11)(12)(13)(14) SPG4 encodes spastin, a 616 amino acid protein, which is a member of the AAA cassette (adenosine triphosphatases associated with diverse cellular activities). Spastin is a microtubule-severing enzyme (15) involved in remodelling protein complexes with adenosine triphosphate (ATP) hydrolysis and coordination of axonal microtubule interactions with the tubular endoplasmic reticulum network.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Novel deletion of SPAST in a Chinese family with hereditary spastic paraplegia

Feng¹,

Ke²,

Zhai³

et al. 2013

smedj

View full text Add to dashboard Cite

RESULTSWe identified a novel 14-bp heterozygous deletion that induced a frameshift mutation in exon 15 of SPAST (SPG4). This mutation is predicted to have functional impact and found to cosegregate with the disease phenotype.CONCLUSION Our results have expanded the mutation spectrum of the SPAST gene. These findings could help clinicians provide prenatal diagnosis of affected foetuses in families with a known history of such neurodegenerative diseases.

show abstract

“…A leggyakrabban pontmutációk fordulnak elő, a betegek mintegy 40%-ában. Depienne és mtsai [19] MLPA-analízist alkalmazva különböző méretű exonikus deletiót észleltek a betegek megközelítőleg 20%-ában. Az MLPAanalízissel beteganyagunkban eddig nem találtunk elté-rést.…”

Section: Megbeszélésunclassified

Genetic testing of hereditary spastic paraplegia

et al. 2015

View full text Add to dashboard Cite

Bevezetés: A herediter spasticus paraplegia progresszív, változó súlyosságú alsó végtagi spasticitással járó, klinikailag és genetikailag is eltérő kórképek összefoglaló neve. Az autoszomális domináns öröklésmenetet mutató herediter spasticus paraplegiák leggyakoribb okai a spastin gén különböző mutációi, incidenciája különböző etnikai csoportokban változó, 15-40%-ra tehető. A génmutáció következtében kialakuló spastin-funkcióvesztés progresszív neuronalis zavarhoz vezet, ami végül axondegenerációt hoz létre. Célkitűzés: A szerzők intézetében 2014 óta elérhető a spastin gén vizsgálata. Közleményükben a szerzők ismertetik az első 11 beteg vizsgálata során nyert tapasztalataikat. Módszer: A spastin gén 17 exonjának vizsgálata során, polimeráz láncreakciót követően, a termékeket Sanger-féle direkt szekvenálással analizálták. A spastin gén nagyobb átrendeződéseinek vizsgálatát multiplex ligatiofüggő pró-baamplifi káció-technikával végezték el. A vizsgálatokra beérkezett vérminták nagy részét az intézet genetikai tanács-adójában részletes fenotípuselemzésen átesett betegek (8 beteg) mintái képezték, kisebb részt a minták külső intéze-tekből érkeztek a laboratóriumba. Eredmények: A 11 beteg molekuláris genetikai vizsgálata során 5 betegben 4 különböző, feltételezhetően patogén mutációt azonosítottak, ebből 1 az irodalomban is ismert. Következtetések: Jelen közleményben a szerzők beszámolnak az első hazai adatokról, amit 11 beteg vizsgálatával szereztek. Öt betegnél mutattak ki mutációt a spastin génben, ez 45,5% gyakoriságot mutat, ami a nemzetközi adatoknak megfelel. A hazai herediter spasticus paraplegiás betegek molekuláris genetikai vizsgálatával és ezt követően a genotípus-fenotípus részletes összehasonlításával értékes, új információk szerezhetők, amelyek a későbbiekben esetleg befolyásol-hatják a terápiás lehetőségeinket, illetve döntéseinket. Orv. Hetil., 2015, 156(3), 113-117.

show abstract

Exon deletions of SPG4 are a frequent cause of hereditary spastic paraplegia

Abstract: Exon deletions in SPG4 are as frequent as point mutations, and SPG4 is responsible for 40% of AD-HSP.

Cited by 106 publications

References 11 publications

A total of 220 patients with autosomal dominant spastic paraplegia do not display mutations in the SLC33A1 gene (SPG42)

A total of 220 patients with autosomal dominant spastic paraplegia do not display mutations in the SLC33A1 gene (SPG42)

Novel deletion of SPAST in a Chinese family with hereditary spastic paraplegia

Genetic testing of hereditary spastic paraplegia

Contact Info

Product

Resources

About