El sistema educativo nacional ha sufrido altibajos en sus indicadores académicos, con mayor énfasis en la Educación Media Superior. La pandemia por COVID-19 agravó esta situación y dejó una marcada desigualdad educativa por el proceso formativo en línea, truncando la trayectoria escolar de estudiantes. El objetivo del trabajo fue analizar los indicadores académicos entre los ciclos 2019-2020 y 2021-2022 en 27 instituciones de la Dirección General de Educación Tecnológica Agropecuaria y Ciencias del Mar en Guerrero, para conocer las experiencias y valorar el grado de satisfacción del proceso enseñanza-aprendizaje en línea con enfoque de investigación mixta. Mediante un muestreo no probabilístico se aplicaron encuestas a 1,802 alumnos y 401 docentes. La matrícula, abandono escolar y eficiencia terminal fueron afectados negativamente durante la pandemia. Las plataformas digitales más utilizadas por docentes y preferidas por alumnos durante su formación en línea fueron Zoom, Microsoft Teams, Google Classroom y Google Meet. Tanto docentes como alumnos realizaron inversiones para lograr acceso a internet y adquirir equipo digital, lo que ocasionó gastos familiares adicionales. Los alumnos argumentaron ventajas de la enseñanza en línea puesto que hicieron uso de materiales didácticos disponibles en la Web con mayor frecuencia; sin embargo, la mayoría de los educandos prefieren retornar a clases presenciales para desarrollar una vida social plena. Los resultados sientan bases para generar políticas públicas sobre capacitación docente y digitalización en las instituciones de educación agropecuaria en México, puesto que el proceso enseñanza-aprendizaje en línea será una práctica común en el futuro inmediato.