O objetivo deste estudo foi estabelecer o perfil de absenteísmo por problemas de saúde dos profissionais de um hospital universitário em Sergipe. Trata-se de um estudo descritivo, transversal e quantitativo, realizado com todos os profissionais de um hospital universitário em Aracaju/SE. A pesquisa foi realizada no mês de maio de 2020, com base nos dados do sistema informatizado de Informações Gerenciais (IG) e nos arquivos eletrônicos do setor de Saúde Ocupacional e Segurança do Trabalho (SOST). Foram incluídos todos afastamentos por problemas de saúde, válidos entre janeiro e dezembro de 2019, dos quais foram coletadas informações sobre o sexo, número de dias perdidos, cargo, despesas com o afastamento e a causa segundo a Classificação Internacional de Doenças – 10ª revisão. Os dados foram agrupados no programa Microsoft Excel 2013 e analisados através do software R Core Team® 2018. Observou-se um total de 2.053 atestados, equivalente a 5.620,50 dias perdidos de trabalho e um custo financeiro de R$1.075.098,93com maior número de atestados foram técnicos de enfermagem (50,2%) e do sexo feminino (83,92%). As principais causas foram: doenças do aparelho respiratório (17,7%), doenças infecciosas e parasitárias (14,8%) e doenças do sistema osteomuscular e do tecido conjuntivo (12,2%). Conclui-se que o absenteísmo reflete as exposições ocupacionais, em especial, dos profissionais de saúde. Este estudo pode contribuir com a elaboração de estratégias de promoção da saúde e prevenção dos agravos decorrentes do trabalho desses profissionais.