La formación de habilidades de investigación en futuros profesores es un tema de creciente interés en diversos países. No obstante, la evidencia de cómo se lleva a cabo este proceso de enseñanza en programas de pedagogía es escasa. Este artículo presenta una autoetnografía colaborativa realizada por tres formadoras de docentes en un contexto transfronterizo del norte chileno. Su ejercicio responde a la pregunta: ¿Cómo enseñamos habilidades de investigación a futuros profesores? Los hallazgos muestran que, aunque utilizan distintos enfoques teóricos, convergen en la importancia de fomentar una alfabetización científica crítica. Lo “crítico” significa incitar a los estudiantes a cuestionar cómo los códigos científicos son útiles y válidos en su contexto.