Huntington hastalığı (HD), kromozomun 4. kolundaki HTT genindeki CAG trinükleotidlerinin tekrarı sonucu beyin nöronlarında ciddi dejenerasyona neden olan ve ölümle sonuçlanabilecek bir hastalıktır. Bu çalışma, Huntington hastalığı ile ilişkili ERN1 ve TRAF2 genlerinin yanlış anlamlı SNP'lerinde potansiyel olarak zararlı etkileri olanların biyoinformatik yazılım araçları kullanılarak belirlenmesini ve bunların proteinlerin fonksiyonları ve stabilizasyonu üzerindeki etkilerinin değerlendirilmesini amaçlamıştır. Yanlış anlamlı SNP'lerin potansiyel olarak zararlı etkilerini tahmin etmek için SNAP2, SIFT, PolyPhen-2 (HumDiv ve HumVar), SNPs&GO, PhD-SNP, PANTHER ve Meta-SNP, protein stabilizasyonu için I-Mutant 2.0 ve MUpro, üç boyutlu modelleme için Project HOPE, gen-gen etkileşimleri için GeneMANIA ve protein-protein etkileşimlerinin belirlenmesi için STRING yazılım araçları kullanıldı. Huntington hastalığı ile ilişkili ERN1 ve TRAF2 genleri için 7 farklı programda 8 yazılım aracı kullanılarak 7’si ve üzerinde ortak zararlı etkiye sahip olan varyantlar seçildi. Sonuç olarak hastalıkla ilişkili olduğu düşünülen ERN1 ve TRAF2 genleri için toplam 4 varyant belirlendi. ERN1 geni için rs138082110 (S224C), rs199512451 (G133R), rs370210153 (P623Q) varyantlarının, TRAF2 geni için ise rs144405558 (C469R) varyantının olası zararlı etkiye sahip olabileceği çalışma sonucunda belirlenmiştir. Bu çalışmalar sonucunda elde edilen veriler Huntington hastalığı ile ilgili yapılacak ileri araştırmalarda ve deneysel çalışmalarda fayda sağlayacaktır.