Funktionsanalyse der Entwicklungskontrollgene Irx2 und Mash1 in der Maus.

Abstract

Das erste ATG liegt bei 209 bp, das zweite bei 491 bp. Als Stop-Kodon wird TAG bei 1631 bp genutzt. Die Homeobox erstreckt sich von 551 bp bis 720 bp und das Sequenzmotiv der Iro-Box liegt bei 1184 bp. Die Nukleotide TGTGAT kennzeichnen die K-Box an Position 1958 bp. Im Northern-Blot hybridisieren zwei Fragmente mit einer Irx2-spezifischen Sonde (=13Sal). Dies bedeutet, dass von Irx2 zwei alternativ gespleißte Formen existieren. Ihre Größen sind im Northern Blot 2,6 kb und 1,9 kb, wobei die analysierten cDNA-Klone mit 2,2 kb und 1,8 kb kleiner sind (Abb. 4). Der Größenunterschied zwischen dem Northern Blot und den Sequenzdaten beruhen auf dem Fehlen des poly-A-Schwanzes in den sequenzierten Klonen. Abb. 4: Northern-Blot mit mRNA von Embryonen an Tag E14,5