Las especies de Eucalyptus son ampliamente plantadas en Chile debido a su rápido crecimiento y adaptabilidad. Sin embargo, la producción y sostenibilidad de plantaciones se ven amenazadas por factores como la escasa disponibilidad de agua y su susceptibilidad a plagas. En esta tesis doctoral se realizó el estudio de la incidencia de la sequía y defoliación por el insecto Gonipterus platensis sobre el metabolismo especializado de árboles de distintas especies de Eucalyptus a través de un enfoque metabolómico basado en UHPLC-QTOF-MS/MS. Se incluyeron las especies de mayor interés comercial, E. globulus, E. nitens, y la especie híbrida E. nitens × E. globulus. Los resultados sugieren que existe una diferencia constitutiva entre E. globulus y E. nitens, predisponia la susceptibilidad frente al ataque de G. platensis. Se evidenció la ausencia de enzimas claves en la especie susceptible E. globulus, como la estilbeno sintasa (STS) y la galato 1-β-glucosiltransferasa. Por otra parte, los resultados metabolómicos del ensayo de estrés hídrico en especies de Eucalyptus, demostró efectos negativos en la biosíntesis de fenilpropanoides, como flavonoles y estilbenos. Pero también se observó que la sequía inducia la regulación de fitoanticipinas en plantas estresadas sugiriendo la preparación para el ataque de plagas.