Genetic Analysis Algorithm for the Study of Patients with Multiple Congenital Anomalies and Isolated Congenital Heart Disease

Abstract

In this work, we aim to identify the genetic causes of pathogenesis in Argentinean patients with multiple congenital anomalies (MCA) and isolated Congenital Heart Disease (iCHD). We recruited 174 MCA and 194 iCHD patients from 15 public hospitals. Karyotyping was performed for MCA patients, and MLPA for conotruncal CHD or suspected 2q11 Deletion Syndrome (22q11DS). Selected samples were analyzed by array-CGH (Comparative genomic hybridization) (n = 89) and/or Next-Generation Sequencing (NGS) (n = 18). We successfully analyzed 252/368 patients: 14 had cytogenetic abnormalities, 27 had imbalances in 22q11, and 16 had other clinically relevant copy number variations (CNVs). NGS revealed 12 relevant nucleotide variants (five novels). Combining molecular, clinical and genetic evaluations, the diagnostic yield was 26.2%.

Humangenetische Aspekte in Orthopädie und Unfallchirurgie

“…Das diagnostische Instrument hierfür ist die Array-CGH (komparative genomische Hybridisierung), mit deren Hilfe ein quantitativer Gesamtüberblick über Vermehrung oder Verluste chromosomalen Materials über das gesamte Genom, also unabhängig von einer spezifischen Fragestellung, erreicht werden kann. Die Array-CGH ist in den vergangenen Jahren zum Standardverfahren bei der Abklärung insbesondere syndromaler, mehrere Organe betreffender Fehlbildungskomplexe oder Behinderungen geworden, die sich in der klinischen Einordnung nicht auf bestimmte einzelne Gene beziehen lassen 3 .…”