Genetic Diversity of the Sockeye Salmon (Oncorhynchus Nerka) From Some Rivers of Eastern Kamchatka and Coastal Part of the Sea of Okhotsk According to Polymorphism Data of Cytochrome B Gene of Mitochondrial Dna

Abstract

Изучено генетическое разнообразие популяций нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum) из рек Восточной Камчатки и материкового побережья Охотского моря с использованием данных об изменчивости гена цитохрома b (cytb) мтДНК. Проведена оценка значимости различий по нуклеотидным заменам и по частотам гаплотипов между парами исследованных популяций. Выявлены различия между неркой из разных регионов (североохотоморского и беринговоморского), а также между изученными локальностями из одного региона. В то же время показано, что доля межпопуляционной генетической изменчивости относительно умеренная (12,67%), что свидетельствует об относительно небольшом времени дивергенции популяций. Модель распределения частот попарных нуклеотидных различий, полученная для популяций из исследованной части ареала вида, позволяет предположить, что локальности нерки образовались в результате слияния генетически отдаленных, конспецифичных популяций. Возможно, в истории вида происходило разделение его ареала, что способствовало образованию двух генетически независимых (на протяжении многих поколений) линий.

Phylogeography of Asian sockeye salmon (Oncorhynchus nerka) based on analysis of mtDNA control region polymorphism

“…Literature and our results (Bachevskaya et al, 2013(Bachevskaya et al, , 2015Brykov et al, 2005;Khrustaleva, 2016) Haplotypes of both haplogroups are found in approximately the same proportion in Lake Azabachye, located in the lower reach of the Kamchatka River, as in other river basins of the Asian coast. It can be assumed that the lower parts of the Kamchatka River were inhabited by fish from other refugia during their expansion after the glacier retreat in the Late Quaternary.…”

“…In addition, it is haploid and characterized by a maternal inheritance (Avise, 2004;Park & Moran, 1994) thus non-recombining mtDNA haplotypes can be linked to each other by a network of sequential evolutionary transformations (Bandelt, Forster, & Röhl, 1999). There are only few papers dedicated to sockeye salmon mtDNA geographical variability in both Pacific Ocean coasts (Bachevskaya, Pereverzeva, & Ivanova, 2013;Bachevskaya et al, 2015;Bickham et al, 1995;Brykov et al, 2005;Churikov et al, 2001;Khrustaleva, 2016;Kondzela & Gharrett, 2007), and they cover just some fragmental areas of sockeye salmon range.…”