Genetic landscape in Russian patients with familial left ventricular noncompaction

Abstract

BackgroundLeft ventricular noncompaction (LVNC) cardiomyopathy is a disorder that can be complicated by heart failure, arrhythmias, thromboembolism, and sudden cardiac death. The aim of this study is to clarify the genetic landscape of LVNC in a large cohort of well-phenotyped Russian patients with LVNC, including 48 families (n=214).MethodsAll index patients underwent clinical examination and genetic analysis, as well as family members who agreed to participate in the clinical study and/or in the genetic testing. The genetic testing included next generation sequencing and genetic classification according to ACMG guidelines.ResultsA total of 55 alleles of 54 pathogenic and likely pathogenic variants in 24 genes were identified, with the largest number in the MYH7 and TTN genes. A significant proportion of variants −8 of 54 (14.8%) −have not been described earlier in other populations and may be specific to LVNC patients in Russia. In LVNC patients, the presence of each subsequent variant is associated with increased odds of having more severe LVNC subtypes than isolated LVNC with preserved ejection fraction. The corresponding odds ratio is 2.77 (1.37 −7.37; p <0.001) per variant after adjustment for sex, age, and family.ConclusionOverall, the genetic analysis of LVNC patients, accompanied by cardiomyopathy-related family history analysis, resulted in a high diagnostic yield of 89.6%. These results suggest that genetic screening should be applied to the diagnosis and prognosis of LVNC patients.

Difficulties in selecting antiarrhythmic therapy in a patient with left ventricular noncompaction and atrial septal defect: a case report

“…Клиническое обследование и анализ вариантов генов пациентов с НМЛЖ и их родственников в когорте российских 48 семей (n=214) продемонстрировал необходимость генетического скрининга [6]. Пациентка от проведения генетического исследования воздержалась.…”

Desmoplakin and features of desmoplakin cardiomyopathy

“…Пробанду была выполнена МРТ сердца по стандартному протоколу с отсроченным внутривенным контрастированием и проведением Т1-, Т2-, ECVкартирования. Молекулярно-генетическое исследование проведено с помощью секвенирования следующего поколения на NextSeq 550 (Illumina, США) с использованием таргетной панели, включающей гены, ассоциированные с разными формами КМП [17]. Биоинформатический анализ и клиническая интерпретация описаны ранее [17].…”

“…Молекулярно-генетическое исследование проведено с помощью секвенирования следующего поколения на NextSeq 550 (Illumina, США) с использованием таргетной панели, включающей гены, ассоциированные с разными формами КМП [17]. Биоинформатический анализ и клиническая интерпретация описаны ранее [17]. Валидация выявленного варианта была проведена методом секвенирования по Сенгеру на Applied Biosystem 3500 Genetic Analyzer (Thermo Fisher Scientific, США).…”

“…Пробанду было проведено молекулярно-генетическое исследование. По результатам секвенирования следующего поколения был выявлен гетерозиготный патогенный вариант в гене DSP (hg19::chr6:7577240del, ENST00000379802.3:c.2842del, ENSP00000369129.3:p. Gln948LysfsTer29) [17], который был подтвержден секвенированием по Сенгеру.…”