Genome structure and origin of nontoxigenic strains of Vibrio cholerae of El Tor biovar with different epidemiological significance

Smirnova, N. I.; Кульшань, Т. А.; Baranikhina, E. Yu.; Krasnov, Ya. M.; Agafonov, D. A.; Кутырев, Владимир

doi:10.1134/s1022795416060120

Cited by 8 publications

(6 citation statements)

References 25 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…The criteria used for clinical symptom classification is listed in S2 Table. To determine the potential gene loss during laboratory culture, the presence/absence of ctxAB, zot, ace, cep and tcpA were examined by PCR amplification within three days of isolation (most were tested within a day). In a previous study, it has been reported that ctxAB genes of V. cholerae isolates can be lost in culture, however, the earliest loss took place four days after isolation and the loss was not only the ctxAB genes but also the other genes of the CTX prophage [29]. Thus, although the ctxAB genes are on a mobile element, the probability of loss during laboratory culturing should be small for our collection.…”

Section: Cholerae Isolatesmentioning

confidence: 90%

Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

Non-toxigenic Vibrio cholerae isolates have been found associated with diarrheal disease globally, however, the global picture of non-toxigenic infections is largely unknown. Among non-toxigenic V. cholerae, ctxAB negative, tcpA positive (CNTP) isolates have the highest risk of disease. From 2001 to 2012, 71 infectious diarrhea cases were reported in Hangzhou, China, caused by CNTP serogroup O1 isolates. We sequenced 119 V. cholerae genomes isolated from patients, carriers and the environment in Hangzhou between 2001 and 2012, and compared them with 850 publicly available global isolates. We found that CNTP isolates from Hangzhou belonged to two distinctive lineages, named L3b and L9. Both lineages caused disease over a long time period with usually mild or moderate clinical symptoms. Within Hangzhou, the spread route of the L3b lineage was apparently from rural to urban areas, with aquatic food products being the most likely medium. Both lineages had been previously reported as causing local endemic disease in Latin America, but here we show that global spread of them has occurred, with the most likely origin of L3b lineage being in Central Asia. The L3b lineage has spread to China on at least three occasions. Other spread events, including from China to Thailand and to Latin America were also observed. We fill the missing links in the global spread of the two non-toxigenic serogroup O1 V. cholerae lineages that can cause human infection. The results are important for the design of future disease control strategies: surveillance of V. cholerae should not be limited to ctxAB positive strains.

show abstract

Section: Cholerae Isolatesmentioning

confidence: 90%

Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…полногеномное секвенирование двух произвольно выбранных му-тантов из 10 полученных, один из которых был про-изводным типичного штамма (м888), а второй -генетически измененного (р18899), показало, что их нетоксигенность обусловлена утратой профага CTXφ, несущего гены ctxAB [3]. для выяснения влияния делеции профага на изменение экспрессии других генов, связанных с биосинтезом дополни-тельных факторов патогенности или выживанием в окружающей среде, проведен сравнительный анализ фенотипов двух пар изогенных штаммов -м888 и м888ΔCTXφ, р18899 и р18899ΔCTXφ.…”

Section: результаты и обсужденияunclassified

“…поскольку сниженная способность к формиро-ванию биопленки у нетоксигенных штаммов могла быть связана не только с изменением продукции VPS, но и их подвижности [3], мы сравнивали изогенные штаммы по этому свойству. в результате установле-но, что делеция профага CTXφ действительно приво-дит к изменению подвижности.…”

Section: результаты и обсужденияunclassified

“…важным следствием этого со-бытия является одновременное изменение несколь-ких других фенотипических свойств, связанных как с вирулентностью (биосинтез TCP, HA/P, VCC), так и с образованием биопленки (VPS и подвижность). проведенный ранее анализ полных геномов сравни-ваемых штаммов показал отсутствие различий меж-ду ними относительно структуры их генов, опреде-ляющих изученные свойства [3]. именно этот факт позволяет говорить о том, что обнаруженные у му-тантов фенотипические особенности, возможно, свя-заны с изменением активности регуляторных генов, прямо или опосредованно контролирующих как па-тогенность, так и процесс формирования биопленки у холерных вибрионов.…”

Section: результаты и обсужденияunclassified

“…холеры, приводя нередко к делеции профага CTXφ, кодирующего ключевой фактор вирулентности воз-будителя [3]. однако сведения о роли делеции про-фага CTXφ в изменении экспрессии генов, опреде-ляющих биосинтез других факторов патогенности, до сих пор весьма немногочисленны.…”

unclassified

See 2 more Smart Citations

Effect of the Prophage Ctxφ Deletion Upon Phenotypic Properties in Strains of Vibrio Cholerae Biovar El Tor, Associated With Virulence and Persistence

Щелканова¹,

Агафонова²,

Ливанова³

et al. 2017

Problemy Osobo Opasnykh Infektsii

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

54Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections] холера остается одной из важнейших проблем для стран азии, африки и Южной америки, на тер-ритории которых сформированы эндемичные очаги. регистрируемые на территории россии локальные вспышки и спорадические случаи холеры обуслов-лены завозом этой инфекции из эндемичных регио-нов [1, 7]. на протяжении последней седьмой пан-демии возбудитель холеры претерпевал различные изменения фено-и генотипа. современный период текущей пандемии (с 1991 г. по настоящее время) характеризуется широким распространением на эндемичных по холере территориях генетически измененных штаммов (геновариантов) V. cholerae биовара эль тор, содержащих в геноме ряд генов возбудителя холеры классического биовара. так, во входящих в состав генома профага CTXφ генах ctxAB, кодирующих холерный токсин или ст (от cholera toxin), присутствует ген ctxB классического биовара (ctxB1). кроме того имеется ряд мутаций и в других генах, участвующих в продукции факторов патогенности. вследствие приобретения части гене-тического материала от холерных вибрионов класси-ческого биовара эти геноварианты являются более вирулентными по сравнению с типичными штамма-ми [2,10, 14]. известно также, что условия окружаю-щей среды влияют на структуру генома возбудителя ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов, Российская Федерация цель работы. изучить влияние делеции профага CTXφ, несущего гены ctxAB, на изменение фенотипических свойств, связанных с патогенностью или формированием биопленки, у нетоксигенных мутантов. материалы и методы. в работе использовали клинические штаммы Vibrio cholerae биовара эль тор и их спонтанные не-токсигенные мутанты, утратившие профаг CTXφ. применены микробиологические и биохимические методы, а также заражение модельных животных (крольчат) клетками исследуемых штаммов. результаты и выводы. представлены результаты сравнительного анализа фенотипических свойств изогенных токсигенных и нетокси-генных штаммов Vibrio cholerae биовара эль тор, утративших профаг CTXφ, кодирующий холерный токсин. установлено, что делеция профага CTXφ приводит к одновременному изменению у спонтанных нетоксигенных мутантов нескольких фенотипических свойств, связанных с вирулентностью (колонизирующей способности, продукции растворимой гемагглютинин/протеазы, термолабильного гемолизина/цитолизина) и формированием биопленки (подвижности, биосинтеза экзополисахарида). высказано предположение, что причиной указанных фенотипических изменений мутантов могли быть изменения активности связанных между собой регуляторных генов, контролирующих вирулентность и процесс образования биопленки у возбудителя холеры.ключевые слова: Vibrio cholerae, профаг CTXφ, делеция, фенотипические свойства. Effect of the Prophage CTXφ Deletion upon Phenotypic Properties in Strains of Vibrio cholerae Biovar El Tor, Associated with Virulence and Persistence Russian Research Anti-Plague Institute "Microbe", Saratov, Russian FederationObjective of the study is to evaluate the inf...

show abstract

Design and Study of Properties of Avirulent Genetically Modified Vibrio cholerae Biovar El Tor Strain with Inactivated Genes of Thermolabile Hemolysin and Effective Expression of Cloned Cholera Toxin B-subunit Gene

Smirnova

Shchelkanova

Baranikhina

et al. 2017

Appl Biochem Microbiol

View full text Add to dashboard Cite

Genome structure and origin of nontoxigenic strains of Vibrio cholerae of El Tor biovar with different epidemiological significance

Cited by 8 publications

References 25 publications

Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages

Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages

Effect of the Prophage Ctxφ Deletion Upon Phenotypic Properties in Strains of Vibrio Cholerae Biovar El Tor, Associated With Virulence and Persistence

Design and Study of Properties of Avirulent Genetically Modified Vibrio cholerae Biovar El Tor Strain with Inactivated Genes of Thermolabile Hemolysin and Effective Expression of Cloned Cholera Toxin B-subunit Gene

Contact Info

Product

Resources

About