Genotypic Characterization of Sulfur-Oxidative Desulfurizing Bacterial Strains Isolated from Mexican Refineries

Abstract

Résumé -Caractérisation génotypique de souches bactériennes isolées de raffineries mexicaines, capables de désulfuration par oxydation du soufre -Nous avons effectué une caractérisation génotypique de nouvelles bactéries désulfurant le dibenzothiophène (DBT) par attaque spécifique de l'atome de soufre, isolées à partir de sols contaminés par des hydrocarbures et provenant de raffineries mexicaines. Nous les avons comparées à deux souches de référence (Rhodococcus erythropolis IGTS8 et R. erythropolis X309). Ces souches de référence ont déjà été très largement étudiées et sont protégées par des brevets, de même que les procédés de désulfuration qui en dérivent. L'objectif de cette étude était d'utiliser des techniques de biologie moléculaire pour caractériser ces souches nouvellement isolées et déterminer si elles étaient différentes des souches brevetées. Les méthodes de caractérisation employées ont été le séquençage partiel du gène de l'ADNr (ribosomal) 16S, l'amplification par PCR des gènes de la désulfuration, l'analyse de fragments de restriction et du polymorphisme après amplification aléatoire de fragments d'ADN (RAPD pour Random Amplified Polymorphic DNA). L'analyse des séquences des gènes de l'ADNr 16S a montré que ces souches n'appartenaient pas à l'espèce R. erythropolis, même si elles contenaient les mêmes gènes dszABC de la désulfuration que R. erythropolis IGTS8. Les profils de RAPD étaient également différents de ceux des souches de référence, confirmant que ces souches étaient différentes des souches déjà brevetées R. erythropolis IGTS8 et X309. Abstract -Genotypic Characterization of Sulfur-Oxidative Desulfurizing Bacterial Strains Isolated from Mexican Refineries

Microtitre Plate Assay for Biofilm Formation, Production and Utilization of Hydroxybiphenyl by Rhodococcus sp. Isolated from Gasoline-Contaminated Soil

“…We found that the isolate did not show any growth on DBT alone and needs another carbon source in a co-metabolism. This result was also observed by other researches on Rhodococcus erythropolis (Bustos-Jaimes et al, 2003;Izumi et al, 1994). However, the thermophilic bacterium Panibacillus should degrade DBT in a CÐC bond-targeted fashion because it utilizes DBT as a sole carbon source (Konishi et al, 1997).…”

“…The sulfur-containing compounds present in petroleum are transformed into sulfur oxides by combustion of fuels, causing serious environmental problems such as acid rain (Bustos-Jaimes et al, 2003). The thermochemical hydrodesulfurization (HDS) process is presently used in refineries for the removal of sulfur, but some sulfur-containing compounds are recalcitrant to it (Matsubara et al, 2001;Tanaka et al, 2002).…”

“…Among these strains, the patented Rhodococcus erythropolis strain IGTS8 has been the most extensively studied one (Bustos-Jaimes et al, 2003).…”

Dimethyl sulfoxide (DMSO) as the sulfur source for the production of desulfurizing resting cells of Gordonia alkanivorans RIPI90A

“…RIPI90A resting cells grown on DMSO were reacted with DBT and DBTO 2 separately, and the results revealed that the Dsz phenotype in this strain could be expressed via the 4S pathway in the presence of DMSO as the sulfur source. DMSO has been found to be more easily metabolized than DBT, and it can also induce the dsz genes (Bustos-Jaimes et al, 2003). However, with resting cells of Rhodococcus sp.…”

Sulfur Removal from Dibenzothiopheneby Newly Isolated Paenibacillusvalidus Strain PD2 and Process Optimizationin Aqueous and Biphasic (Model-Oil) Systems

“…P. validus PD2 was cultured in the presence of different sulfur compounds. As shown in Table III, a higher cell density was obtained when DMSO was used as the sole sulfur source, because of more easily metabolization of DMSO than others sulfur sources (Bustos-Jaimes et al, 2003). Moreover, the growth rate can be inhibited by production of 2-HBP when DBT is used as the sulfur source (Setti et al, 2003).…”