El establecimiento de Áreas Protegidas (AP) como contrapartida al avance de las presiones de la sociedad sobre los ecosistemas y paisajes naturales, se considera como la principal estrategia para la preservación de la biodiversidad en nuestro planeta. Varios principios y métodos han sido formulados y aplicados en las últimas décadas con el fin de optimizar la selección, planificación y gestión de estas áreas. Por otro lado, la Geoecología del Paisaje como enfoque científico integrador y transdiciplinar, ofrece una base importante para entender la compleja dinámica entre la sociedad y la naturaleza, proporcionando mediante criterios e indicadores determinados, el análisis y el diagnóstico de las unidades de paisaje, que permitan realizar de forma adecuada este proceso. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo es la exposición y análisis de los aspectos teóricos y metodológicos utilizados por la Geoecología del Paisaje para la selección, planificación y gestión de las AP, proporcionando las bases para su aplicación a casos específicos.