Guar genes to genome and meta-analysis of SSR markers in sequencing studies

Pareek, Shalini; Jaiswal, Poonam Subhash; Shrivastava, Divya Rishi

doi:10.1007/s10722-022-01420-8

Cited by 3 publications

(5 citation statements)

References 59 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Order By: Relevance

“…Although the degree of drought tolerance varies significantly among the guar genotypes, the metabolic features underlying these differences at the metabolome and proteome level remain poorly understood. To date, predominantly genomics and transcriptomics approaches were successfully employed in the study of guar genetic resources [34,72,98,99], whereas proteomics and metabolomics studies are still to be conducted.…”

Section: Genomics and Post-genomics Techniques In The Study Of Drough...mentioning

confidence: 99%

“…Thus, several agronomic traits, like growth patterns and the number of seeds per pod and beans per plant, were addressed as AFLP-related breeding markers [24], whereas SSRs were recently employed in the studies of guar genetic diversity [98]. Also, Grigorieva and co-workers proposed SNPs, which were potentially efficient as markers associated with the traits underlying high seed productivity (i.e., the number of matured beans on the plant) of guar plants [102].…”

Section: Guar Genome Resources For Breeding Of New Prospective Drough...mentioning

confidence: 99%

“…For example, a meta-analysis of microsatellite SSR markers accomplished by Pareek and co-workers delivered several genes promising for prospective guar breeding programs, including work on new drought-tolerant cultivars [98]. The transcriptome database established by Thakur and co-workers by sequencing of the total mRNA pool in two guar varieties, RGC-1066 and M-83, contained 5773 potential microsatellite SSR-and 3594 SNPbased markers associated with the genes involved in stress tolerance [106].…”

Section: Guar Genome Resources For Breeding Of New Prospective Drough...mentioning

confidence: 99%

See 2 more Smart Citations

Drought Stress Response in Guar (Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub): Physiological and Molecular Genetic Aspects

Vishnyakova,

Frolova,

Frolov

2023

Plants

View full text Add to dashboard Cite

Drought has become one of the main factors of crop yield losses worldwide. This negatively affects the plant industry, decreasing crop yields, and it may result in resource deficits in different sectors of the world economy and its national branches. Guar (Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub) represents one of the strategic crops, as its seeds are the source of guar gum, which is critically important in the modern oil industry. Although guar is generally known to be a drought-tolerant plant, it is known that soil dehydration negatively affects plant fitness and crop productivity. As guar genotypes are characterized by high variability in the manifestation of drought tolerance, screening genetic resources for this feature seems to be a promising strategy for accessing drought-resistant varieties. The discovery of drought-tolerant genotypes is mandatory to secure sustainable guar production. In this context, the identification of reliable chemical and molecular markers of drought tolerance (i.e., drought-responsive and/or drought-protective metabolites, proteins and transcripts) will provide the solid basis for marker-driven breeding of new tolerant varieties. Therefore, here we provide a comprehensive overview of the available literature data on guar drought stress response, its physiological and molecular genetic aspects, and considerations on the approaches to improve the quality of this crop.

show abstract

Section: Genomics and Post-genomics Techniques In The Study Of Drough...mentioning

confidence: 99%

Section: Guar Genome Resources For Breeding Of New Prospective Drough...mentioning

confidence: 99%

Section: Guar Genome Resources For Breeding Of New Prospective Drough...mentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Drought Stress Response in Guar (Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub): Physiological and Molecular Genetic Aspects

Vishnyakova,

Frolova,

Frolov

2023

Plants

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…С помощью AFLP маркеров изучали ряд агрономических селекционно значимых признаков: число семян в бобе и бобов на растении, характер роста ( (48). SSR использовали для изучения генетического разнообразия (49). Выделены SNP, которые могут быть эффективны в отношении признака, определяющего высокую семенную продуктивность гуара, -числа вызревших бобов на растении (50).…”

Section: характеристика сортов гуараunclassified

“…The whole range of these issues is outlined in this review as the objectives that domestic guar breeders face when creating gum-forming varieties. Prospects of marker-assisted selection and genomic breeding are under discussion (S. Kumar et al, 2020; E. Gigoreva et al, 2021; S. Pareek et al, 2022). The created domestic varieties of guar were obtained by traditional breeding, but the active development of genomic, metabolomic and transcriptomic resources of the species allow us to hope for a quick practical application of breakthrough methods of crop breeding that will increase crop yield and adaptation in the conditions of the Russian Federation.…”

Section: характеристика сортов гуараmentioning

confidence: 99%

СЕЛЕКЦИЯ ГУАРА В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В СВЯЗИ С ПЕРСПЕКТИВОЙ ПРОИЗВОДСТВА ОТЕЧЕСТВЕННОЙ КАМЕДИ (Обзор)

САФРОНОВА¹

2023

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Доместикация гуара произошла в Индии и Пакистане, где его в течение веков выращивали как кормовое растение (N. Thombare с соавт., 2016). Эти страны и в наши дни остаются главными производителями и экспортерами культуры, но уже как продуцента камеди. В рамках импортозамещения гуар был интродуцирован в Российскую Федерацию, где в течение последнего десятилетия в некоторых районах Южного федерального округа и Нижнего Поволжья получают производственные партии кондиционных семян. Экспериментальные партии камеди, извлеченной из отечественных семян, показали, что она по количеству и качеству соответствует нормативам (I.V. Kruchina-Bogdanov с соавт., 2019). Есть все основания предполагать, что в ближайшем будущем гуаровая камедь будет производиться в России. Для интенсификации производства гуара требуется создание новых, адаптированных к условиям РФ сортов. Несколько отечественных сортов уже создано, в том числе четыре сорта выведены в ФИЦ Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова -ВИР (Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию, 2022). Поскольку получение камеди зависит от семенной продуктивности культуры, достаточно остро стоит вопрос повышения ее урожайности (A.K. Jukanti с соавт., 2019). Однако в РФ, где главный лимитирующий фактор для гуара -это теплообеспеченность (Д.В. Лебедь с соавт., 2017), приоритетным признаком становится скороспелость, которая, в свою очередь, связана с чувствительностью растения к фотопериоду. Поэтому необходим поиск в генофонде форм с пониженной чувствительностью к фотопериоду, способных в условиях сравнительно короткого лета производить полноценные семена (S.B. Teplyakova с соавт., 2019). При интродукции культуры в более северные широты в условиях длительного вегетационного периода при понижении ночных температур и повышенной влажности у гуара формируются некачественные, темнеющие в бобах семена (T. Hymovitz с соавт., 1963; Д.В. Лебедь с соавт., 2018). В связи с этим в РФ важно использовать максимально скороспелые, ранние сорта гуара. Встает вопрос об оптимальной для условий РФ архитектонике растений, способствующей формированию высокопродуктивных агроценозов (М.И. Волошин с соавт., 2019). Многие исследователи рекомендуют использовать одностебельные и малостебельные сорта гуара как более скороспелые и пригодные к механизированной уборке, они в большей степени соответствуют индустриальной модели сорта (F. Gresta с соавт., 2018; C.M.G. Reis с соавт., 2021). Также к раннеспелым относятся сорта с детерминантным типом роста (Е.А. Дзюбенко с соавт., 2017). Гуар, как и большинство других однолетних бобовых культур, относится к самоопылителям (R.E. Stafford с соавт., 1975), техника его гибридизации сложна, и процент успешно проведенных скрещиваний невысок (R.E. Stafford с соавт., 1980). Основной метод традиционной селекции у гуара -индивидуальный отбор выделившихся растений (A.K. Jukanti с соавт., 2019). Исследователи сходятся во мнении, что для повышения урожайности культуры ключевым индексом для отбора должен быть показатель количеств...

show abstract

Quantification of hormones and profiling of metabolites from vegetative to reproductive growth phase shift in Lagenaria siceraria (Molina) Standl

Singh,

Krishnan,

Raman

2024

Scientia Horticulturae

View full text Add to dashboard Cite

Guar genes to genome and meta-analysis of SSR markers in sequencing studies

Cited by 3 publications

References 59 publications

Drought Stress Response in Guar (Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub): Physiological and Molecular Genetic Aspects

Drought Stress Response in Guar (Cyamopsis tetragonoloba (L.) Taub): Physiological and Molecular Genetic Aspects

СЕЛЕКЦИЯ ГУАРА В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В СВЯЗИ С ПЕРСПЕКТИВОЙ ПРОИЗВОДСТВА ОТЕЧЕСТВЕННОЙ КАМЕДИ (Обзор)

Quantification of hormones and profiling of metabolites from vegetative to reproductive growth phase shift in Lagenaria siceraria (Molina) Standl

Contact Info

Product

Resources

About