Objetivo: Describir los resultados de los exámenes de laboratorio realizados en muestras biológicas de pacientescon síndrome de Guillain-Barré (SGB), recibidas en el Instituto Nacional de Salud (INS) entre los años 2018y 2019. Materiales y métodos: Se realizó un estudio observacional en pacientes con SGB notificados en elsistema de vigilancia epidemiológica. Se obtuvieron muestras biológicas analizadas en el INS para investigararbovirus, virus respiratorios, enterovirus y enterobacterias, entre otros. Resultados: Se recibió un total de2051 especímenes clínicos de 906 pacientes con SGB. Tres pacientes dieron positivo al dengue y tres pacientesal Zika. En 19 pacientes, el cultivo en heces fue positivo para Campylobacter jejuni. El análisis filogenético dediez cepas de Campylobacter jejuni las clasificó como genotipo ST2993, reportado previamente en China yasociado a un brote de SGB. En 2018, hubo 12 muestras que habían dado positivo al PCR para enterovirus enel líquido cefalorraquídeo, pero ninguna pudo corroborarse con el cultivo respectivo ni con secuenciamientode genoma completo. Un paciente dio positivo por virus de la influenza A, dos por virus de la influenza B, dospor adenovirus, cinco por virus respiratorio sincicial, y diez por rinovirus. Conclusión: Se han encontradodiversos agentes patógenos en especímenes de pacientes con SGB, sin embargo, la presencia de Campylobacterjejuni genotipo ST2993, un patógeno relacionado a brotes de SGB en varios continentes, sería el probable agentecausal. Es necesario confirmar esta hipótesis con estudios analíticos y determinar la cadena de transmisión deeste agente para implementar las medidas de prevención y control.