La presencia de ciertos mamíferos es un indicador de la situación de conservación que muchas comunidades ostentan, su evaluación, en diferentes espacios seleccionados bajo ciertos indicadores; aun dentro de una misma zona, evidencian su importancia. En esta investigación, se presentan resultados de los censos de mamíferos realizados en diversos puntos en tres Ejidos de la Reserva de la Biosfera Montes Azules en la selva Lacandona por medio de rastros directos. El estudio se llevó a cabo de septiembre del 2018 a julio de 2019, con un esfuerzo total de muestreo de tres salidas. Se obtuvo un total de 17 especies, distribuidas en 12 familias y 7 órdenes fueron identificadas, al menos un tipo de rastro, directo o indirecto. Los mamíferos más comunes fueron: mapaches, pecaríes y tapires, respectivamente. Mientras que las especies con menor cantidad de avistamientos fueron Dasyprocta punctata, Caluromys derbianus, Nasua narica y Eira barbara, este último en peligro de extinción. El patrón de actividad de especies como el tepezcuintle, mostró hábitos nocturnos y otras como el jaguar solo fueron censados por la presencia de huellas. Algunas especies mostraron diferencias con los patrones mencionados por otros autores, las cuales se relacionan principalmente con la estacionalidad y la disponibilidad de recursos.