Herramientas bioinformáticas usadas en el estudio de enzimas fenoloxidasas del género Pleurotus

Abstract

El análisis bioinformático permite relacionar, predecir y analizar un conjunto de proteínas de interés que comparten áreas conservadas en común a través de un computador (in silico). Este análisis bioinformático se realiza a partir de la secuencia de bases de datos, dominios y de regiones clave que conforman la función catalítica de una proteína. La secuencia de aminoácidos proporciona una predicción correspondiente a las regiones conservadas. Posteriormente las secuencias de aminoácidos se acoplan de manera ordenada por su función y estructura, mismas que generan proyecciones espaciales de estructuras terciarias que permiten el reconocimiento de secuencias claves para mutaciones coordinadas. La bioinformática en las enzimas fenoloxidasa como lacasa, manganeso peroxidasa y decolorante peroxidasa permite observar estructuras proteicas, cadenas alfa y beta, así como los iones responsables de la catálisis. Las técnicas in silico juegan un papel importante en áreas como la medicina, la biotecnología y la genómica en beneficio de la salud humana. La técnica de secuenciación de ADN identifica organismos por medio de secuencias de aminoácidos tomadas de bancos de datos para elaborar proteínas molde, alineamiento de secuencias, modelamientos por homología y la validación o identificación de organismos.

Lacasa Mecanismo De Acción Y Actividad Biológica

“…El sistema enzimático de las fenoloxidasas está compuesto por dos actividades enzimáticas principales, siendo la primera por oxidasas y la segunda por peroxidasas, estas enzimas son capaces de actuar de forma directa en el polímero de la lignina. Las enzimas peroxidas están presentes en la mayoría de hongos que degradan lignina además pueden estar presentes en procesos naturales de lignocelulosa (36)(37).…”