Heterokonts (Xanthophyceae and Chrysophyceae) in Rivers

NecchiJr., Orlando

doi:10.1007/978-3-319-31984-1_7

Cited by 4 publications

(3 citation statements)

References 7 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…S6E). Chrysophyceae (golden algae) commonly occupy river systems (Necchi ) including the MSR (Korajkic et al ), can be autotrophic and mixotrophic (Jansson et al ), and may serve as predators of prokaryotes (Caron et al ). Further, multiple OTUs classified as Peronosporomycetes were important in predicting phosphate in both size fractions (Fig.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Nutrient dynamics and stream order influence microbial community patterns along a 2914 kilometer transect of the Mississippi River

Henson

Hanssen

Spooner

et al. 2018

Limnology & Oceanography

View full text Add to dashboard Cite

Draining 31 states and roughly 3 million km 2 , the Mississippi River (MSR) and its tributaries constitute an essential resource to millions of people for clean drinking water, transportation, agriculture, and industry. Since the turn of the 20 th century, MSR water quality has continually rated poorly due to human activity.Acting as first responders, microorganisms can mitigate, exacerbate, and/or serve as predictors for water quality, yet we know little about their community structure or ecology at the whole river scale for large rivers. We collected both biological (16S and 18S rRNA gene amplicons) and physicochemical data from 38 MSR sites over nearly 3000 km from Minnesota to the Gulf of Mexico. Our results revealed a microbial community composed of similar taxa to other rivers but with unique trends in the relative abundance patterns among phyla, operational taxonomic units (OTUs), and the core microbiome. Furthermore, we observed a separation in microbial communities that mirrored the transition from an 8 th to 10 th Strahler order river at the Missouri River confluence, marking a different start to the lower MSR than the historical distinction at the Ohio River confluence in Cairo, IL. Within MSR microbial assemblages, we identified subgroups of OTUs from the phyla Acidobacteria, Bacteroidetes, Oomycetes, and Heterokonts that were associated with, and predictive of, the important eutrophication nutrients nitrate and phosphate. This study offers the most comprehensive view of MSR microbiota to date, provides important groundwork for higher resolution microbial studies of river perturbation, and identifies potential microbial indicators of river health related to eutrophication.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Nutrient dynamics and stream order influence microbial community patterns along a 2914 kilometer transect of the Mississippi River

Henson

Hanssen

Spooner

et al. 2018

Limnology & Oceanography

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Chrysolaminarin is known as the primary assimilative product of the genus Tribonema [ 21 ], but few studies have investigated differences in the ability to accumulate this compound. Therefore, six Tribonema species were cultured in mBG-11 medium to screen for a chrysolaminarin-producing algal strain.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

Isolation, Characterization and Immunomodulatory Activity Evaluation of Chrysolaminarin from the Filamentous Microalga Tribonema aequale

et al. 2022

View full text Add to dashboard Cite

The aim of this study is to investigate the differences in the accumulation capacity of chrysolaminarin among six Tribonema species and to isolate this polysaccharide for immunomodulatory activity evaluation. The results showed that T. aequale was the most productive strain with the highest content and productivity of chrysolaminarin, which were 17.20% (% of dry weight) and 50.91 mg/L/d, respectively. Chrysolaminarin was then extracted and isolated from this alga, and its monosaccharide composition was mainly composed of a glucose (61.39%), linked by β-D-(1→3) (main chain) and β-D -(1→6) (branch chain) glycosidic bonds, with a molecular weight of less than 6 kDa. In vitro immunomodulatory assays showed that it could activate RAW264.7 cells at a certain concentration (1000 μg/mL), as evidenced by the increased phagocytic activity and upregulated mRNA expression levels of IL-1β, IL6, TNF-α and Nos2. Moreover, Western blot revealed that this polysaccharide stimulated the phosphorylation of p-65, p-38 and JNK in NF-κB and MAPK signaling pathways. Overall, these findings provide a reference for the further development and utilization of algae-based chrysolaminarin, while also offering an in-depth understanding of the immunoregulatory mechanism.

show abstract

“…4). Επίσης υπάρχει η χρυσολαμιναρίνη (chrysolaminarin), ουσία η οποία αποθηκεύεται στα χυμοτόπια (Necchi, 2016). Ως οργανισμοί χαρακτηρίζονται αυτότροφοι/φωτοσυνθετικοί αλλά ανάλογα με τις περιβαλλοντικές συνθήκες μπορεί να μετατραπούν σε ετερότροφούς ή μικτότροφους οργανισμούς χάνοντας το χαρακτηριστικό τους χρώμα.…”

Section: χρυσοφυκηunclassified

Μελέτη Και Αξιολόγηση Μικροφυκών Ως Πηγή Προϊόντων Υψηλής Προστιθέμενης Αξίας

Χατζηκωνσταντίνου¹

View full text Add to dashboard Cite

Σκοπός της παρούσας διατριβής ήταν η μελέτη των ακατέργαστων υδατικών εκχυλισμάτων από μικροφύκη Chlorella sp., Nannochloropsis sp., Tetraselmis sp. και Phaeodactylum sp.. Μια τέτοια μελέτη στοχεύει στην ανάγκη εύρεσης νέων πράσινων πηγών, πλούσιων σε αντιοξειδωτικές ουσίες, ώστε να χρησιμοποιηθούν ως πρώτες ύλες στη βιομηχανία τροφίμων και καλλυντικών. Επιπρόσθετα, μελετήθηκαν ένζυμα GSTs από το γένος Chlamydomonas με στόχο την απόκτηση περαιτέρω γνώσεων που σχετίζονται με GSTs από θαλάσσιους οργανισμούς.Με στόχο την κατανόηση του ρόλου των GSTs στους φωτοσυνθετικούς οργανισμούς αλλά και την εύρεση στοιχείων για την ανάπτυξη νέων βιοτεχνολογικών εφαρμογών, ακολούθησε η μελέτη του γονιδιώματος Chlamidomonas reinhardtii. Τα αποτελέσματα φανέρωσαν την παρουσία 15 GST-like ενζύμων (CrGSTs) τα οποία αναλύθηκαν φυλογενετικά. Τα ισοένζυμα CrGST10 και CrGST7, που φαίνεται να ανήκουν στη Sigma τάξη, κλωνοποιήθηκαν, εκφράστηκαν σε βακτηριακά κύτταρα E. coli και προσδιορίστηκε η εκλεκτικότητά τους έναντι ηλεκτρονιόφιλων υποστρωμάτων. Ακολούθησε μελέτη της δομής και της κινητικής συμπεριφοράς με μοριακή μοντελοποίηση και κατευθυνόμενη μεταλλαξογέννεση. Συγκεκριμένα, επιβεβαιώθηκε ο καταλυτικός ρόλος του αμινοξέος Tyr7 ενώ διερευνήθηκε ο ρόλος του αμινοξέος Trp99 στον προσδιορισμό εξειδίκευσης ηηλεκτρονιόφιλων υποστρωμάτων, στην επίδραση του pH και στη θερμοσταθερότητα.Η διατριβή ολοκληρώθηκε με την απομόνωση του ενζύμου CrGST8 από cDNA βιβλιοθήκηChlamidomonas, το οποίο φαίνεται να ανήκει στην τάξη Theta. Η υπερέκφραση του ενζύμου CrGST8 οδήγησε σε ενδοκυτταρική συσσώρευση μερικώς αναδιπλωμένων πρωτεϊνών (έγκλειστα σωμάτια). Ακολούθησαν δοκιμές βελτιστοποίησης των συνθηκών έκφρασης με χρήση διαφορετικής συγκέντρωσης IPTG και θερμοκρασίας. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι συγκεκριμένοι παράγοντες δεν επηρεάζουν στη δημιουργία των συσσωματωμάτων. Στη συνέχεια έγινε χρήση χαοτροπικών ουσιών όπως η ουρία και το χλωρίδιο του γουανιδίου. Με σκοπό τον έλεγχο της επίδρασης μιας ηπιότερης μεθόδου αναδίπλωσης, έγινε δοκιμή διαλυτοποίησης του ενζύμου με χρήση προπανόλης. Θετικά αποτελέσματα παρουσίασαν μόνο οι χαοτροπικές ουσίες και κυρίως η ουρία. Έπειτα πραγματοποιήθηκε μελέτη της εκλεκτικότητας του ενζύμου έναντι διαφορετικών υποστρωμάτων. Η επίδραση του pH στην ενζυμική δραστικότητα του CrGST8 έδειξε ότι εμφανίζει προτίμηση στην όξινη περιοχή των pH με μέγιστη τιμή στο pH 5,6, ενώ σε pH 7 η ενζυμική δραστικότητα έχει σχεδόν μηδενιστεί.Συνοψίζοντας, τα μικροφύκη έχουν κεντρίσει την προσοχή του βιομηχανικού τομέα, με την εφαρμογή τους να απαντάται σε ποικιλία προϊόντων όπως σε τρόφιμα, φάρμακα και καλλυντικά. Η χρήση αντιοξειδωτικών από φυσικές και πράσινες πηγές όπως τα μικροφύκη αντιπροσωπεύει έναν τομέα που κερδίζει μεγάλο ενδιαφέρον στη διάρκεια του χρόνου με ευρύ φάσμα βιοτεχνολογικών εφαρμογών. Τα ευρήματά μας υπογραμμίζουν ότι τα εκχυλίσματα των ειδών Chlorella και κυρίως του στελέχους Chlorella minutissima, αντιπροσωπεύουν πολλά υποσχόμενα βιοδραστικά συστατικά με δυνατότητα χρήσης τους ως πρώτες ύλες. Tέλος, ο χαρακτηρισμός των ενζύμων CrGST10, CrGST7 και CrGST8 από το στέλεχος Chlamydomonas reinhardtii και η φυλογενετική ανάλυση έδωσαν πληροφορίες σχετικά με την εξέλιξη της οικογένειας των GSTs και το μηχανισμό δέσμευσης του υποστρώματος και εξειδίκευσης.

show abstract

Heterokonts (Xanthophyceae and Chrysophyceae) in Rivers

Cited by 4 publications

References 7 publications

Nutrient dynamics and stream order influence microbial community patterns along a 2914 kilometer transect of the Mississippi River

Nutrient dynamics and stream order influence microbial community patterns along a 2914 kilometer transect of the Mississippi River

Isolation, Characterization and Immunomodulatory Activity Evaluation of Chrysolaminarin from the Filamentous Microalga Tribonema aequale

Μελέτη Και Αξιολόγηση Μικροφυκών Ως Πηγή Προϊόντων Υψηλής Προστιθέμενης Αξίας

Contact Info

Product

Resources

About