El presente trabajo tuvo como objetivo identificar parásitos gastrointestinales en reptiles mantenidos en cautiverio en Lima Metropolitana. Se trabajó con reptiles de los parques zonales Huáscar (Villa El Salvador) y Sinchi Roca (Comas), del zoológico del Colegio El Buen Pastor y del serpentario del Instituto Nacional de Salud. Se recolectaron 133 muestras de heces de Chelonoidis denticulata (89), Boa constrictor (11), Iguana iguana (6), Trachemys scripta (3), Bothrops atrox (5), Bothrops barnetti (3), Epicrates cenchria (3), Crotalus durissus terrificus (2) y de otras nueve especies. Las muestras fueron procesadas mediante los métodos de diagnóstico parasitológico directo, de Ritchie, de Faust y frotis fecal con tinción Ziehl Neelsen. Se encontró Nyctotherus sp (72/89), Balantidium sp (56/89) y Sauricola sp (21/89) en C. denticulata; Alaeuris sp (4/6) y Ozolaimus sp (3/6) en I. iguana; ooquistes de Cryptosporidium sp (35/89) en C. denticulata; larvas de Rhabdias sp (2/5) en B. atrox y huevos del pentastómido Porocephalus sp (1/3) en E. cenchria. Los resultados demuestran que los reptiles son portadores de varias especies de parásitos, incluyendo especies con potencial zoonótico.