Identification and genotyping of white spot syndrome virus (WSSV) isolated from Litopenaeus vannameiin the state Rio Grande do Norte

Abstract

The aim of our investigation was to detect WSSV in Litopenaues vannamei from farms in Rio Grande do Norte (RN) state, as well as perform genotyping of the isolates. A total of five farms were surveyed, from which 10 samples were collected in each one. We selected two ponds in each of the

Variaciones genotípicas del Virus del Síndrome de las Manchas Blancas (VSMB) aislados en langostinos de cultivo de Perú

“…Notably, this count was lower than that observed in reference strains from Taiwan (Wang et al, 1995), China, and Thailand (Table 3). Similarly, it is also lower than four strains from Brazil (Muller et al, 2010;Rodrigues et al, 2020) and six strains from Mexico (Ramos-Paredes et al, 2017). Conversely, it paralleled the RU count in ORF 75 but lagged in ORF 94 compared to five strains isolated in Vietnam (Dieu et al, 2004).…”

“…En comparación con las cepas del VSMB aisladas en otros países, los ocho genotipos detectados presentan un número intermedio de URs en los ORFs 75 y 94. La cantidad de URs es menor que las cepas de referencia de Taiwán , China y Tailandia (Tabla 3), de igual forma, también es menor que cuatro cepas de Brasil (Muller et al, 2010;Rodrigues et al, 2020) y seis cepas de México (Ramos-Paredes et al, 2017). En comparación con cinco cepas aisladas en Vietnam (Dieu et al, 2004), la cantidad de URs detectados en este trabajo es similar en el ORF 75 pero inferior al número de URs del ORF 94.…”

“…Based on genomic mapping conducted by Marks et al (2004) on WSSV strains collected La identificación de las regiones variables del ADN, han permitido tipificar al genoma del VSMB en diferentes países de América (Muller et al, 2010;Ramos-Paredes et al, 2017;Pereira et al, 2019;Rodrigues et al, 2020), África (Tang et al, 2013;Onihary et al, 2021) y Asia (Dieu et al, 2004;Pradeep et al, 2008;Li et al, 2016;Min et al, 2023). Además, ha permitido reconstruir las rutas epidemiológicas que ha seguido el VSMB durante su dispersión a través del mundo (Zeng, 2021), así como también evaluar los cambios que se pueden presentar en su virulencia (Marks et al, 2005;Li et al, 2016;Ramos-Paredes et al, 2017;Min et al, 2023).…”

“…Identification of variable DNA regions has facilitated WSSV genome typing across the Americas (Muller et al, 2010;Ramos-Paredes et al, 2017;Pereira et al, 2019;Rodrigues et al, 2020), África (Tang et al, 2013;Onihary et al, 2021), and Asia (Dieu et al, 2004;Pradeep et al, 2008;Li et al, 2016;Min et al, 2023). This information has enabled the reconstruction of the epidemiological routes taken by WSSV during its global dissemination (Zeng, 2021), and the assessment of potential changes in virulence (Marks et al, 2005;Li et al, 2016;Ramos-Paredes et al, 2017;Min et al, 2023).…”