IDENTIFIKASI DAN KLASIFIKASI BAKTERI AMILOLITIK ISOLAT TG12, TG19, DAN TG31 PENYEBAB KEMASAMAN PADA TEPUNG SAGU BASAH BERDASARKAN ANALISIS GEN 16SrDNA

Abstract

16SrDNA gene were known essentialy for procaryotic life involved bacteria. The gene very concerved such as usefull for bacterial identification and classification in phylogeny tree constructed. The object of this research were identified and cllassified amylolitic bacteria TG12, TG19 and TG31 isolates, causers sourness on raw starch sago by 16SrDNA gene sequences analysis approach. The native isolates from raw starch sago under traditionality processing arround Jayapura and selected depend on activity amylolitic and organic acid productivity. Before DNA genom extraction, isolates were throught out generic assignment analysis. Futhermore DNA genom were amplified and purified by PCR with 27f and 1529r primers. The pure of DNA was sequenced by ABI PRISM 310 DNA sequencer with internal primers 27f, 357f, 790f and 1230f. The generic assignment resulted those isolates related with Bacillus. The 16S rDNA data were aligned with corresponding available Bacillus sequences retrieved from the NCBI database using the CLUSTAL X software. Phylogeny tree was constructed by PHYLIP programme and visualized by Treeview programme. Phylogenetic trees were and the extended the value of 16S rDNA sequencing in amylolitic bacteria causing sourness on raw starch sago. Completed 16S rDNA sequence data showed that two of the tested isolate TG12 formed a distinct center of diversity with Bacillus substilis DSM 10 AJ276351, isolate TG19 with Bacillus substilis strain 1778 EU982544 and TG31 similar genetic with Bacillus cereus strain WJL-063 FJ527559. Identification based on 16S rDNA gene sequences of amylolitic bacteria causing sourness on raw sago starch provided a powerful way of uncovering genetic of strain within the spesies Bacillus substilis and Bacillus cereus.

Pelatihan Pengoperasian dan Pemeliharaan Mesin Pengolah Sagu bagi Masyarakat Pemerhati Sagu di Jayapura

“…Secara tradisional batang sagu diekstrak tepung sagu melalui tahapan pemotongan batang, pembelahan dengan kampak, penokokkan dengan alat penokok (nani), ekstraksi pada batang sagu yang berujung pada kain blacu terikat pada ujung batang pelepah daun, dan diendapkan pada kolam pengendap dari terpal plastik, selanjutnya didapatkan tepung sagu basah. Pengerjaan ini akan memakan waktu satu minggu dengan hasil sekitar 150 kg/batang secara tradisional (Gunaedi, 2011) dan secara mekanis pada umumnya 250 kg/batang (Singhal dkk., 2008).…”

Aktivitas Enzim Amilase Isolat Bakteri Amilolitik dari Tepung Sagu Basah dan Lingkungan Tempat Penyediaannya Secara Tradisional di Jayapura

“…Dasar yang digunakan untuk uji aktivitas amilase adalah pengurangan jumlah substrat, yang ditandai dengan penurunan intensitas warna biru dari kompleks pati iodine pada spektrofotometer dengan panjang gelombang 700 nm (Gunaedi, 2009). Aktivitas enzim amilase ditentukan dengan formula:…”

“…DUN/ml (Dextrinizing unit per ml); R0, OD enzim pada 0 menit dan R1, OD enzim pada 1 jam menurut Espino dan Tambalo tahun 1997 (Gunaedi, 2009). Aktivitas spesifik α-amilase diperoleh dengan membandingkan antara aktivitas enzim (DUN/ml) dengan kadar protein (mg/ml).…”

“…Isolat mempunyai ciri morfologi yang berbeda satu yang lain (Gambar 1), dari 46 isolat bakteri yang ditemukan. Gunaedi (2009) telah berhasil mengisolasi 118 bakteri amillolitik dari berbagai sampel yang berasal dari beberapa lokasi sentra penyedia sagu secara tradisional.…”

“…Kadar protein dari ekstrak enzim kasar ditetapkan dengan metode Bradford (1976) menggunakan bovine serum albumin (BSA) sebagai standard.Persamaan garis linier y= 0,264 X+0,00131, R 2 =0,99 yang diperoleh pada pembuatan kurva standar BSA dapat digunakan untuk perhitungan kandungan protein enzim amilase sampel. Menurut Lee dan Fujio, tahun 1997, untuk mengukur kadar protein sampel didahului dengan mengekstrak protein atau enzim ektrak kasar sampel terlebih dahulu dengan menumbuhkan inokulan pada media minimal pati cair (ammonium sulphate starch medium) pada konsentrasi pati 1%, digojog pada 120 rpm, suhu 30 0 C dan waktu inkubasi 48 jam (Gunaedi, 2009). Pengukuran aktivitas enzim amilase, menunjukkan bahwa aktivitas enzim setiap isolat berbeda, isolat yang memilki daya amilolitik tertinggi tidak selalu menghasilakan aktivitas tertinggi bila dibandingkan isolat yang lain hal ini terlhat pada SU4 dan SU23, tetapi pada pengujian aktifias specifik enzim isolat yang memiliki daya amilolitik tertinggi signifikan dengan nilai aktivitas enzim spesifiknya (Tabel 2).…”